Protein–RNA interactions for Protein: P97333

Nrp1, Neuropilin-1, mousemouse

Predictions only

Length 923 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nrp1P97333 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Nrp1P97333 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Nrp1P97333 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Nrp1P97333 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Nrp1P97333 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Nrp1P97333 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Nrp1P97333 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Nrp1P97333 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Nrp1P97333 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Nrp1P97333 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Nrp1P97333 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Nrp1P97333 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Nrp1P97333 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Nrp1P97333 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Nrp1P97333 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Nrp1P97333 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Nrp1P97333 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Nrp1P97333 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Nrp1P97333 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Nrp1P97333 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Nrp1P97333 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Nrp1P97333 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Nrp1P97333 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Nrp1P97333 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Nrp1P97333 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Nrp1P97333 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Nrp1P97333 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Nrp1P97333 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Nrp1P97333 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Nrp1P97333 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
Nrp1P97333 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Nrp1P97333 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Nrp1P97333 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Nrp1P97333 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Nrp1P97333 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Nrp1P97333 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Nrp1P97333 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Nrp1P97333 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Nrp1P97333 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
Nrp1P97333 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Nrp1P97333 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Nrp1P97333 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Nrp1P97333 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Nrp1P97333 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Nrp1P97333 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Nrp1P97333 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Nrp1P97333 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Nrp1P97333 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Nrp1P97333 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Nrp1P97333 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Nrp1P97333 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Nrp1P97333 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
Nrp1P97333 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Nrp1P97333 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Nrp1P97333 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Nrp1P97333 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Nrp1P97333 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Nrp1P97333 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Nrp1P97333 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Nrp1P97333 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Nrp1P97333 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Nrp1P97333 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Nrp1P97333 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Nrp1P97333 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Nrp1P97333 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
Nrp1P97333 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Nrp1P97333 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Nrp1P97333 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Nrp1P97333 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Nrp1P97333 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC27■■□□□ 1.91
Nrp1P97333 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Nrp1P97333 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Nrp1P97333 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Nrp1P97333 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Nrp1P97333 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Nrp1P97333 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Nrp1P97333 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Nrp1P97333 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Nrp1P97333 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Nrp1P97333 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Nrp1P97333 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Nrp1P97333 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Nrp1P97333 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Nrp1P97333 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
Nrp1P97333 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Nrp1P97333 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
Nrp1P97333 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Nrp1P97333 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Nrp1P97333 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Nrp1P97333 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Nrp1P97333 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Nrp1P97333 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
Nrp1P97333 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
Nrp1P97333 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Nrp1P97333 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Nrp1P97333 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Nrp1P97333 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Nrp1P97333 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Nrp1P97333 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Nrp1P97333 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms