Protein–RNA interactions for Protein: P83917

Cbx1, Chromobox protein homolog 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cbx1P83917 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
Cbx1P83917 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Cbx1P83917 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Cbx1P83917 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Cbx1P83917 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Cbx1P83917 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Cbx1P83917 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Cbx1P83917 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Cbx1P83917 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
Cbx1P83917 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Cbx1P83917 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Cbx1P83917 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Cbx1P83917 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Cbx1P83917 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Cbx1P83917 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Cbx1P83917 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Cbx1P83917 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Cbx1P83917 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Cbx1P83917 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Cbx1P83917 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Cbx1P83917 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Cbx1P83917 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Cbx1P83917 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Cbx1P83917 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Cbx1P83917 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Cbx1P83917 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Cbx1P83917 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Cbx1P83917 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Cbx1P83917 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Cbx1P83917 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Cbx1P83917 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Cbx1P83917 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Cbx1P83917 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Cbx1P83917 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Cbx1P83917 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Cbx1P83917 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Cbx1P83917 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Cbx1P83917 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Cbx1P83917 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Cbx1P83917 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
Cbx1P83917 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
Cbx1P83917 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Cbx1P83917 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Cbx1P83917 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Cbx1P83917 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Cbx1P83917 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Cbx1P83917 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Cbx1P83917 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Cbx1P83917 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Cbx1P83917 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Cbx1P83917 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Cbx1P83917 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Cbx1P83917 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Cbx1P83917 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Cbx1P83917 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Cbx1P83917 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Cbx1P83917 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Cbx1P83917 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Cbx1P83917 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Cbx1P83917 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
Cbx1P83917 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Cbx1P83917 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Cbx1P83917 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Cbx1P83917 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Cbx1P83917 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Cbx1P83917 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Cbx1P83917 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Cbx1P83917 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Cbx1P83917 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Cbx1P83917 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Cbx1P83917 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Cbx1P83917 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Cbx1P83917 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Cbx1P83917 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Cbx1P83917 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Cbx1P83917 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
Cbx1P83917 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Cbx1P83917 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Cbx1P83917 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Cbx1P83917 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Cbx1P83917 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Cbx1P83917 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Cbx1P83917 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Cbx1P83917 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Cbx1P83917 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Cbx1P83917 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Cbx1P83917 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Cbx1P83917 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Cbx1P83917 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Cbx1P83917 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Cbx1P83917 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
Cbx1P83917 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Cbx1P83917 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Cbx1P83917 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Cbx1P83917 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Cbx1P83917 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Cbx1P83917 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Cbx1P83917 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Cbx1P83917 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Cbx1P83917 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.2 ms