Protein–RNA interactions for Protein: P83887

Tubg1, Tubulin gamma-1 chain, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubg1P83887 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tubg1P83887 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tubg1P83887 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tubg1P83887 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tubg1P83887 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tubg1P83887 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tubg1P83887 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tubg1P83887 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tubg1P83887 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tubg1P83887 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tubg1P83887 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tubg1P83887 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tubg1P83887 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tubg1P83887 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tubg1P83887 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tubg1P83887 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tubg1P83887 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tubg1P83887 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tubg1P83887 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tubg1P83887 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tubg1P83887 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tubg1P83887 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tubg1P83887 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Tubg1P83887 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tubg1P83887 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tubg1P83887 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tubg1P83887 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tubg1P83887 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tubg1P83887 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tubg1P83887 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tubg1P83887 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tubg1P83887 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tubg1P83887 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tubg1P83887 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tubg1P83887 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tubg1P83887 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tubg1P83887 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tubg1P83887 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Tubg1P83887 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Tubg1P83887 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Tubg1P83887 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Tubg1P83887 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tubg1P83887 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tubg1P83887 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tubg1P83887 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tubg1P83887 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tubg1P83887 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Tubg1P83887 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tubg1P83887 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Tubg1P83887 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tubg1P83887 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tubg1P83887 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tubg1P83887 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tubg1P83887 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tubg1P83887 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Tubg1P83887 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tubg1P83887 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tubg1P83887 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Tubg1P83887 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tubg1P83887 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tubg1P83887 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Tubg1P83887 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Tubg1P83887 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Tubg1P83887 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tubg1P83887 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tubg1P83887 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tubg1P83887 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tubg1P83887 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Tubg1P83887 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Tubg1P83887 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tubg1P83887 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tubg1P83887 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tubg1P83887 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tubg1P83887 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tubg1P83887 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tubg1P83887 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tubg1P83887 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tubg1P83887 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tubg1P83887 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tubg1P83887 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tubg1P83887 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tubg1P83887 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tubg1P83887 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tubg1P83887 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tubg1P83887 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tubg1P83887 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tubg1P83887 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tubg1P83887 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tubg1P83887 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tubg1P83887 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tubg1P83887 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tubg1P83887 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tubg1P83887 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tubg1P83887 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tubg1P83887 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tubg1P83887 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Tubg1P83887 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tubg1P83887 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tubg1P83887 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tubg1P83887 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms