Protein–RNA interactions for Protein: P81117

Nucb2, Nucleobindin-2, mousemouse

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nucb2P81117 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Nucb2P81117 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Nucb2P81117 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Nucb2P81117 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Nucb2P81117 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Nucb2P81117 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Nucb2P81117 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Nucb2P81117 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Nucb2P81117 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Nucb2P81117 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Nucb2P81117 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Nucb2P81117 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Nucb2P81117 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Nucb2P81117 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Nucb2P81117 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Nucb2P81117 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
Nucb2P81117 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Nucb2P81117 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Nucb2P81117 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Nucb2P81117 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Nucb2P81117 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Nucb2P81117 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
Nucb2P81117 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Nucb2P81117 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Nucb2P81117 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Nucb2P81117 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Nucb2P81117 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Nucb2P81117 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Nucb2P81117 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
Nucb2P81117 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Nucb2P81117 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Nucb2P81117 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Nucb2P81117 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Nucb2P81117 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Nucb2P81117 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Nucb2P81117 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Nucb2P81117 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Nucb2P81117 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Nucb2P81117 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Nucb2P81117 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Nucb2P81117 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Nucb2P81117 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Nucb2P81117 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Nucb2P81117 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Nucb2P81117 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Nucb2P81117 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Nucb2P81117 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Nucb2P81117 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Nucb2P81117 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Nucb2P81117 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Nucb2P81117 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Nucb2P81117 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Nucb2P81117 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Nucb2P81117 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Nucb2P81117 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Nucb2P81117 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Nucb2P81117 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Nucb2P81117 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Nucb2P81117 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Nucb2P81117 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Nucb2P81117 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Nucb2P81117 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Nucb2P81117 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Nucb2P81117 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Nucb2P81117 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Nucb2P81117 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Nucb2P81117 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Nucb2P81117 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Nucb2P81117 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Nucb2P81117 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Nucb2P81117 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Nucb2P81117 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Nucb2P81117 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Nucb2P81117 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Nucb2P81117 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Nucb2P81117 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Nucb2P81117 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Nucb2P81117 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Nucb2P81117 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Nucb2P81117 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Nucb2P81117 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Nucb2P81117 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Nucb2P81117 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Nucb2P81117 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
Nucb2P81117 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Nucb2P81117 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Nucb2P81117 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Nucb2P81117 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Nucb2P81117 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Nucb2P81117 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Nucb2P81117 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Nucb2P81117 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Nucb2P81117 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Nucb2P81117 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Nucb2P81117 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Nucb2P81117 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Nucb2P81117 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
Nucb2P81117 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Nucb2P81117 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Nucb2P81117 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.1 ms