Protein–RNA interactions for Protein: P79568

H2-Q6, Class Ib MHC antigen Qa-2, mousemouse

Predictions only

Length 326 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Q6P79568 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
H2-Q6P79568 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
H2-Q6P79568 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
H2-Q6P79568 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
H2-Q6P79568 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
H2-Q6P79568 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
H2-Q6P79568 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
H2-Q6P79568 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
H2-Q6P79568 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
H2-Q6P79568 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
H2-Q6P79568 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
H2-Q6P79568 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
H2-Q6P79568 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
H2-Q6P79568 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
H2-Q6P79568 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
H2-Q6P79568 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
H2-Q6P79568 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
H2-Q6P79568 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
H2-Q6P79568 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
H2-Q6P79568 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
H2-Q6P79568 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
H2-Q6P79568 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
H2-Q6P79568 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
H2-Q6P79568 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
H2-Q6P79568 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
H2-Q6P79568 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
H2-Q6P79568 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
H2-Q6P79568 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
H2-Q6P79568 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
H2-Q6P79568 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
H2-Q6P79568 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
H2-Q6P79568 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
H2-Q6P79568 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
H2-Q6P79568 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
H2-Q6P79568 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
H2-Q6P79568 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
H2-Q6P79568 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
H2-Q6P79568 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
H2-Q6P79568 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
H2-Q6P79568 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
H2-Q6P79568 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
H2-Q6P79568 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
H2-Q6P79568 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
H2-Q6P79568 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
H2-Q6P79568 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
H2-Q6P79568 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
H2-Q6P79568 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
H2-Q6P79568 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
H2-Q6P79568 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
H2-Q6P79568 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
H2-Q6P79568 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
H2-Q6P79568 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
H2-Q6P79568 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
H2-Q6P79568 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
H2-Q6P79568 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.36
H2-Q6P79568 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
H2-Q6P79568 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
H2-Q6P79568 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
H2-Q6P79568 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
H2-Q6P79568 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
H2-Q6P79568 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
H2-Q6P79568 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
H2-Q6P79568 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
H2-Q6P79568 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
H2-Q6P79568 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
H2-Q6P79568 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
H2-Q6P79568 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
H2-Q6P79568 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
H2-Q6P79568 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
H2-Q6P79568 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
H2-Q6P79568 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
H2-Q6P79568 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
H2-Q6P79568 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
H2-Q6P79568 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
H2-Q6P79568 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
H2-Q6P79568 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
H2-Q6P79568 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
H2-Q6P79568 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
H2-Q6P79568 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
H2-Q6P79568 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
H2-Q6P79568 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
H2-Q6P79568 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
H2-Q6P79568 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
H2-Q6P79568 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
H2-Q6P79568 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
H2-Q6P79568 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
H2-Q6P79568 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
H2-Q6P79568 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
H2-Q6P79568 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
H2-Q6P79568 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
H2-Q6P79568 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
H2-Q6P79568 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
H2-Q6P79568 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
H2-Q6P79568 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
H2-Q6P79568 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
H2-Q6P79568 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
H2-Q6P79568 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
H2-Q6P79568 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
H2-Q6P79568 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
H2-Q6P79568 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms