Protein–RNA interactions for Protein: P70451

Fer, Tyrosine-protein kinase Fer, mousemouse

Predictions only

Length 823 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FerP70451 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
FerP70451 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
FerP70451 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
FerP70451 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
FerP70451 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
FerP70451 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
FerP70451 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
FerP70451 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
FerP70451 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
FerP70451 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
FerP70451 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
FerP70451 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
FerP70451 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
FerP70451 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
FerP70451 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
FerP70451 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
FerP70451 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
FerP70451 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
FerP70451 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
FerP70451 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
FerP70451 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
FerP70451 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
FerP70451 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
FerP70451 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
FerP70451 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
FerP70451 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
FerP70451 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
FerP70451 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
FerP70451 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
FerP70451 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
FerP70451 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
FerP70451 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
FerP70451 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
FerP70451 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
FerP70451 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
FerP70451 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
FerP70451 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
FerP70451 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
FerP70451 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
FerP70451 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
FerP70451 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
FerP70451 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
FerP70451 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
FerP70451 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
FerP70451 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
FerP70451 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
FerP70451 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
FerP70451 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
FerP70451 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
FerP70451 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
FerP70451 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
FerP70451 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
FerP70451 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
FerP70451 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
FerP70451 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
FerP70451 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
FerP70451 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
FerP70451 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
FerP70451 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
FerP70451 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
FerP70451 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
FerP70451 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
FerP70451 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
FerP70451 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
FerP70451 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
FerP70451 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
FerP70451 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
FerP70451 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
FerP70451 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
FerP70451 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
FerP70451 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
FerP70451 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
FerP70451 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
FerP70451 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
FerP70451 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
FerP70451 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
FerP70451 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
FerP70451 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
FerP70451 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
FerP70451 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
FerP70451 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
FerP70451 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
FerP70451 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
FerP70451 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
FerP70451 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
FerP70451 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
FerP70451 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
FerP70451 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
FerP70451 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
FerP70451 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
FerP70451 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
FerP70451 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
FerP70451 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
FerP70451 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
FerP70451 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
FerP70451 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
FerP70451 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
FerP70451 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
FerP70451 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
FerP70451 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 801.2 ms