Protein–RNA interactions for Protein: P70407

Cdh9, Cadherin-9, mousemouse

Predictions only

Length 786 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdh9P70407 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Cdh9P70407 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Cdh9P70407 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Cdh9P70407 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Cdh9P70407 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
Cdh9P70407 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Cdh9P70407 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Cdh9P70407 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Cdh9P70407 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
Cdh9P70407 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Cdh9P70407 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Cdh9P70407 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Cdh9P70407 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Cdh9P70407 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Cdh9P70407 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Cdh9P70407 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Cdh9P70407 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Cdh9P70407 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Cdh9P70407 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Cdh9P70407 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Cdh9P70407 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Cdh9P70407 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Cdh9P70407 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Cdh9P70407 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Cdh9P70407 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Cdh9P70407 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Cdh9P70407 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Cdh9P70407 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Cdh9P70407 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
Cdh9P70407 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Cdh9P70407 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Cdh9P70407 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Cdh9P70407 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Cdh9P70407 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Cdh9P70407 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Cdh9P70407 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Cdh9P70407 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Cdh9P70407 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Cdh9P70407 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Cdh9P70407 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
Cdh9P70407 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
Cdh9P70407 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Cdh9P70407 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Cdh9P70407 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Cdh9P70407 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Cdh9P70407 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Cdh9P70407 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Cdh9P70407 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Cdh9P70407 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Cdh9P70407 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Cdh9P70407 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Cdh9P70407 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Cdh9P70407 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Cdh9P70407 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Cdh9P70407 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Cdh9P70407 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Cdh9P70407 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Cdh9P70407 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Cdh9P70407 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Cdh9P70407 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC26.14■■□□□ 1.77
Cdh9P70407 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Cdh9P70407 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Cdh9P70407 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Cdh9P70407 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Cdh9P70407 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Cdh9P70407 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Cdh9P70407 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Cdh9P70407 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Cdh9P70407 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Cdh9P70407 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Cdh9P70407 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Cdh9P70407 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Cdh9P70407 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Cdh9P70407 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Cdh9P70407 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Cdh9P70407 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
Cdh9P70407 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Cdh9P70407 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Cdh9P70407 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Cdh9P70407 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Cdh9P70407 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Cdh9P70407 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Cdh9P70407 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Cdh9P70407 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Cdh9P70407 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Cdh9P70407 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Cdh9P70407 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
Cdh9P70407 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Cdh9P70407 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Cdh9P70407 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Cdh9P70407 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
Cdh9P70407 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Cdh9P70407 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
Cdh9P70407 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Cdh9P70407 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Cdh9P70407 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Cdh9P70407 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Cdh9P70407 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Cdh9P70407 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Cdh9P70407 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms