Protein–RNA interactions for Protein: P70288

Hdac2, Histone deacetylase 2, mousemouse

Predictions only

Length 488 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac2P70288 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Hdac2P70288 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Hdac2P70288 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Hdac2P70288 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Hdac2P70288 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Hdac2P70288 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Hdac2P70288 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Hdac2P70288 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Hdac2P70288 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Hdac2P70288 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Hdac2P70288 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Hdac2P70288 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Hdac2P70288 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Hdac2P70288 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Hdac2P70288 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Hdac2P70288 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Hdac2P70288 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Hdac2P70288 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Hdac2P70288 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Hdac2P70288 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Hdac2P70288 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Hdac2P70288 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Hdac2P70288 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Hdac2P70288 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Hdac2P70288 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Hdac2P70288 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Hdac2P70288 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Hdac2P70288 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Hdac2P70288 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Hdac2P70288 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Hdac2P70288 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Hdac2P70288 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Hdac2P70288 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Hdac2P70288 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Hdac2P70288 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Hdac2P70288 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Hdac2P70288 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Hdac2P70288 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Hdac2P70288 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Hdac2P70288 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Hdac2P70288 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Hdac2P70288 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Hdac2P70288 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Hdac2P70288 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Hdac2P70288 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Hdac2P70288 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Hdac2P70288 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Hdac2P70288 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Hdac2P70288 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Hdac2P70288 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Hdac2P70288 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Hdac2P70288 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Hdac2P70288 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Hdac2P70288 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Hdac2P70288 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Hdac2P70288 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Hdac2P70288 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Hdac2P70288 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Hdac2P70288 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Hdac2P70288 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Hdac2P70288 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Hdac2P70288 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Hdac2P70288 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Hdac2P70288 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Hdac2P70288 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Hdac2P70288 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Hdac2P70288 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Hdac2P70288 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Hdac2P70288 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Hdac2P70288 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Hdac2P70288 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Hdac2P70288 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Hdac2P70288 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Hdac2P70288 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Hdac2P70288 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Hdac2P70288 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Hdac2P70288 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Hdac2P70288 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Hdac2P70288 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Hdac2P70288 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Hdac2P70288 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Hdac2P70288 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Hdac2P70288 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Hdac2P70288 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Hdac2P70288 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Hdac2P70288 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Hdac2P70288 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Hdac2P70288 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Hdac2P70288 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Hdac2P70288 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Hdac2P70288 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Hdac2P70288 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Hdac2P70288 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Hdac2P70288 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Hdac2P70288 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Hdac2P70288 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Hdac2P70288 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Hdac2P70288 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Hdac2P70288 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Hdac2P70288 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms