Protein–RNA interactions for Protein: P70279

Surf6, Surfeit locus protein 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Surf6P70279 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Surf6P70279 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Surf6P70279 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Surf6P70279 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Surf6P70279 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Surf6P70279 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Surf6P70279 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Surf6P70279 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Surf6P70279 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Surf6P70279 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Surf6P70279 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Surf6P70279 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Surf6P70279 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Surf6P70279 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Surf6P70279 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Surf6P70279 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Surf6P70279 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
Surf6P70279 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
Surf6P70279 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Surf6P70279 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Surf6P70279 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Surf6P70279 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Surf6P70279 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Surf6P70279 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Surf6P70279 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Surf6P70279 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Surf6P70279 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Surf6P70279 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Surf6P70279 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Surf6P70279 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Surf6P70279 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Surf6P70279 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
Surf6P70279 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Surf6P70279 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
Surf6P70279 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Surf6P70279 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Surf6P70279 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Surf6P70279 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Surf6P70279 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Surf6P70279 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Surf6P70279 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Surf6P70279 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Surf6P70279 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Surf6P70279 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Surf6P70279 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Surf6P70279 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Surf6P70279 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
Surf6P70279 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Surf6P70279 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Surf6P70279 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
Surf6P70279 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Surf6P70279 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Surf6P70279 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Surf6P70279 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Surf6P70279 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Surf6P70279 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Surf6P70279 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Surf6P70279 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Surf6P70279 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Surf6P70279 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Surf6P70279 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Surf6P70279 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Surf6P70279 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Surf6P70279 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Surf6P70279 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Surf6P70279 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Surf6P70279 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Surf6P70279 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Surf6P70279 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Surf6P70279 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Surf6P70279 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Surf6P70279 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Surf6P70279 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Surf6P70279 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Surf6P70279 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Surf6P70279 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Surf6P70279 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
Surf6P70279 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Surf6P70279 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Surf6P70279 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Surf6P70279 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Surf6P70279 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Surf6P70279 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Surf6P70279 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Surf6P70279 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Surf6P70279 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Surf6P70279 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Surf6P70279 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Surf6P70279 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Surf6P70279 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Surf6P70279 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Surf6P70279 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Surf6P70279 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Surf6P70279 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
Surf6P70279 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Surf6P70279 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Surf6P70279 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Surf6P70279 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Surf6P70279 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Surf6P70279 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.2 ms