Protein–RNA interactions for Protein: P70193

Lrig1, Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,091 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrig1P70193 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Lrig1P70193 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Lrig1P70193 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Lrig1P70193 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Lrig1P70193 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Lrig1P70193 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Lrig1P70193 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Lrig1P70193 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Lrig1P70193 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Lrig1P70193 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Lrig1P70193 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Lrig1P70193 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Lrig1P70193 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Lrig1P70193 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Lrig1P70193 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Lrig1P70193 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Lrig1P70193 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Lrig1P70193 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Lrig1P70193 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Lrig1P70193 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Lrig1P70193 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Lrig1P70193 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Lrig1P70193 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Lrig1P70193 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Lrig1P70193 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Lrig1P70193 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Lrig1P70193 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Lrig1P70193 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Lrig1P70193 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Lrig1P70193 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Lrig1P70193 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Lrig1P70193 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Lrig1P70193 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Lrig1P70193 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Lrig1P70193 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Lrig1P70193 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Lrig1P70193 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Lrig1P70193 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Lrig1P70193 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Lrig1P70193 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Lrig1P70193 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Lrig1P70193 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Lrig1P70193 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Lrig1P70193 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Lrig1P70193 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Lrig1P70193 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Lrig1P70193 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Lrig1P70193 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Lrig1P70193 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Lrig1P70193 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Lrig1P70193 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Lrig1P70193 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Lrig1P70193 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Lrig1P70193 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Lrig1P70193 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Lrig1P70193 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Lrig1P70193 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Lrig1P70193 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Lrig1P70193 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Lrig1P70193 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Lrig1P70193 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
Lrig1P70193 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Lrig1P70193 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Lrig1P70193 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Lrig1P70193 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Lrig1P70193 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Lrig1P70193 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Lrig1P70193 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Lrig1P70193 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Lrig1P70193 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Lrig1P70193 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Lrig1P70193 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Lrig1P70193 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Lrig1P70193 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Lrig1P70193 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Lrig1P70193 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Lrig1P70193 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Lrig1P70193 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Lrig1P70193 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Lrig1P70193 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Lrig1P70193 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Lrig1P70193 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Lrig1P70193 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Lrig1P70193 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Lrig1P70193 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Lrig1P70193 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Lrig1P70193 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Lrig1P70193 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Lrig1P70193 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Lrig1P70193 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Lrig1P70193 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Lrig1P70193 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Lrig1P70193 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Lrig1P70193 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Lrig1P70193 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Lrig1P70193 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Lrig1P70193 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Lrig1P70193 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Lrig1P70193 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Lrig1P70193 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.6 ms