Protein–RNA interactions for Protein: P62743

Ap2s1, AP-2 complex subunit sigma, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap2s1P62743 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ap2s1P62743 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Ap2s1P62743 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ap2s1P62743 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ap2s1P62743 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ap2s1P62743 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ap2s1P62743 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ap2s1P62743 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Ap2s1P62743 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ap2s1P62743 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ap2s1P62743 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ap2s1P62743 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ap2s1P62743 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ap2s1P62743 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Ap2s1P62743 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ap2s1P62743 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ap2s1P62743 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ap2s1P62743 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
Ap2s1P62743 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ap2s1P62743 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ap2s1P62743 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ap2s1P62743 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ap2s1P62743 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ap2s1P62743 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ap2s1P62743 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ap2s1P62743 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ap2s1P62743 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ap2s1P62743 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ap2s1P62743 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ap2s1P62743 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ap2s1P62743 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ap2s1P62743 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ap2s1P62743 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ap2s1P62743 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ap2s1P62743 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ap2s1P62743 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ap2s1P62743 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ap2s1P62743 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ap2s1P62743 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ap2s1P62743 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ap2s1P62743 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ap2s1P62743 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ap2s1P62743 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ap2s1P62743 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Ap2s1P62743 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Ap2s1P62743 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ap2s1P62743 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Ap2s1P62743 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ap2s1P62743 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ap2s1P62743 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Ap2s1P62743 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ap2s1P62743 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Ap2s1P62743 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ap2s1P62743 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ap2s1P62743 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ap2s1P62743 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ap2s1P62743 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ap2s1P62743 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ap2s1P62743 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ap2s1P62743 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ap2s1P62743 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ap2s1P62743 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ap2s1P62743 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ap2s1P62743 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ap2s1P62743 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ap2s1P62743 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ap2s1P62743 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ap2s1P62743 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ap2s1P62743 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ap2s1P62743 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ap2s1P62743 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ap2s1P62743 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ap2s1P62743 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ap2s1P62743 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ap2s1P62743 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ap2s1P62743 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ap2s1P62743 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ap2s1P62743 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ap2s1P62743 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ap2s1P62743 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ap2s1P62743 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ap2s1P62743 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ap2s1P62743 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ap2s1P62743 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ap2s1P62743 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ap2s1P62743 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ap2s1P62743 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ap2s1P62743 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ap2s1P62743 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ap2s1P62743 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ap2s1P62743 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ap2s1P62743 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ap2s1P62743 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ap2s1P62743 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ap2s1P62743 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ap2s1P62743 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ap2s1P62743 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ap2s1P62743 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ap2s1P62743 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ap2s1P62743 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.8 ms