Protein–RNA interactions for Protein: P62320

Snrpd3, Small nuclear ribonucleoprotein Sm D3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snrpd3P62320 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Snrpd3P62320 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Snrpd3P62320 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Snrpd3P62320 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Snrpd3P62320 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Snrpd3P62320 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Snrpd3P62320 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Snrpd3P62320 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Snrpd3P62320 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Snrpd3P62320 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Snrpd3P62320 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Snrpd3P62320 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Snrpd3P62320 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Snrpd3P62320 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Snrpd3P62320 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Snrpd3P62320 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Snrpd3P62320 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Snrpd3P62320 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Snrpd3P62320 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Snrpd3P62320 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Snrpd3P62320 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Snrpd3P62320 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Snrpd3P62320 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Snrpd3P62320 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Snrpd3P62320 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Snrpd3P62320 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Snrpd3P62320 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Snrpd3P62320 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Snrpd3P62320 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Snrpd3P62320 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Snrpd3P62320 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Snrpd3P62320 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Snrpd3P62320 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Snrpd3P62320 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Snrpd3P62320 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Snrpd3P62320 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Snrpd3P62320 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Snrpd3P62320 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Snrpd3P62320 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Snrpd3P62320 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Snrpd3P62320 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Snrpd3P62320 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Snrpd3P62320 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Snrpd3P62320 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Snrpd3P62320 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Snrpd3P62320 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Snrpd3P62320 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Snrpd3P62320 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Snrpd3P62320 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Snrpd3P62320 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Snrpd3P62320 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Snrpd3P62320 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Snrpd3P62320 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Snrpd3P62320 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Snrpd3P62320 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Snrpd3P62320 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Snrpd3P62320 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Snrpd3P62320 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Snrpd3P62320 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Snrpd3P62320 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Snrpd3P62320 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Snrpd3P62320 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Snrpd3P62320 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Snrpd3P62320 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Snrpd3P62320 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Snrpd3P62320 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Snrpd3P62320 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Snrpd3P62320 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Snrpd3P62320 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Snrpd3P62320 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Snrpd3P62320 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Snrpd3P62320 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Snrpd3P62320 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Snrpd3P62320 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Snrpd3P62320 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Snrpd3P62320 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Snrpd3P62320 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Snrpd3P62320 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Snrpd3P62320 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Snrpd3P62320 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Snrpd3P62320 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Snrpd3P62320 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Snrpd3P62320 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Snrpd3P62320 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Snrpd3P62320 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Snrpd3P62320 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Snrpd3P62320 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Snrpd3P62320 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Snrpd3P62320 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Snrpd3P62320 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Snrpd3P62320 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Snrpd3P62320 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Snrpd3P62320 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Snrpd3P62320 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Snrpd3P62320 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Snrpd3P62320 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Snrpd3P62320 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Snrpd3P62320 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Snrpd3P62320 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Snrpd3P62320 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.7 ms