Protein–RNA interactions for Protein: P62080

Tspan5, Tetraspanin-5, mousemouse

Predictions only

Length 268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspan5P62080 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tspan5P62080 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tspan5P62080 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tspan5P62080 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tspan5P62080 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Tspan5P62080 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tspan5P62080 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tspan5P62080 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tspan5P62080 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Tspan5P62080 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tspan5P62080 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tspan5P62080 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tspan5P62080 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tspan5P62080 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tspan5P62080 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tspan5P62080 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tspan5P62080 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tspan5P62080 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Tspan5P62080 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tspan5P62080 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tspan5P62080 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tspan5P62080 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tspan5P62080 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tspan5P62080 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Tspan5P62080 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Tspan5P62080 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Tspan5P62080 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Tspan5P62080 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Tspan5P62080 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Tspan5P62080 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Tspan5P62080 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tspan5P62080 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tspan5P62080 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tspan5P62080 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tspan5P62080 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tspan5P62080 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tspan5P62080 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tspan5P62080 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tspan5P62080 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tspan5P62080 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tspan5P62080 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Tspan5P62080 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Tspan5P62080 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Tspan5P62080 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Tspan5P62080 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tspan5P62080 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tspan5P62080 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tspan5P62080 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tspan5P62080 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tspan5P62080 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tspan5P62080 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Tspan5P62080 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tspan5P62080 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tspan5P62080 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tspan5P62080 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tspan5P62080 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tspan5P62080 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tspan5P62080 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tspan5P62080 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tspan5P62080 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tspan5P62080 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tspan5P62080 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tspan5P62080 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tspan5P62080 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tspan5P62080 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tspan5P62080 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Tspan5P62080 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tspan5P62080 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tspan5P62080 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tspan5P62080 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tspan5P62080 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tspan5P62080 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tspan5P62080 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tspan5P62080 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Tspan5P62080 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tspan5P62080 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tspan5P62080 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tspan5P62080 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tspan5P62080 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tspan5P62080 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tspan5P62080 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tspan5P62080 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tspan5P62080 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tspan5P62080 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Tspan5P62080 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Tspan5P62080 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tspan5P62080 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tspan5P62080 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tspan5P62080 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tspan5P62080 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tspan5P62080 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tspan5P62080 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Tspan5P62080 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tspan5P62080 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tspan5P62080 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tspan5P62080 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tspan5P62080 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tspan5P62080 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tspan5P62080 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tspan5P62080 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.6 ms