Protein–RNA interactions for Protein: P61967

Ap1s1, AP-1 complex subunit sigma-1A, mousemouse

Predictions only

Length 158 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap1s1P61967 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC25,63■■□□□ 1,69
Ap1s1P61967 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25,63■■□□□ 1,69
Ap1s1P61967 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,62■■□□□ 1,69
Ap1s1P61967 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC25,62■■□□□ 1,69
Ap1s1P61967 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC25,61■■□□□ 1,69
Ap1s1P61967 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC25,61■■□□□ 1,69
Ap1s1P61967 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25,61■■□□□ 1,69
Ap1s1P61967 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,61■■□□□ 1,69
Ap1s1P61967 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,59■■□□□ 1,69
Ap1s1P61967 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC25,59■■□□□ 1,69
Ap1s1P61967 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,59■■□□□ 1,69
Ap1s1P61967 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC25,58■■□□□ 1,69
Ap1s1P61967 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC25,58■■□□□ 1,69
Ap1s1P61967 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,58■■□□□ 1,68
Ap1s1P61967 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25,56■■□□□ 1,68
Ap1s1P61967 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25,56■■□□□ 1,68
Ap1s1P61967 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25,54■■□□□ 1,68
Ap1s1P61967 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC25,53■■□□□ 1,68
Ap1s1P61967 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,53■■□□□ 1,68
Ap1s1P61967 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25,52■■□□□ 1,68
Ap1s1P61967 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,52■■□□□ 1,68
Ap1s1P61967 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC25,51■■□□□ 1,67
Ap1s1P61967 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25,49■■□□□ 1,67
Ap1s1P61967 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC25,49■■□□□ 1,67
Ap1s1P61967 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,49■■□□□ 1,67
Ap1s1P61967 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,48■■□□□ 1,67
Ap1s1P61967 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25,48■■□□□ 1,67
Ap1s1P61967 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC25,47■■□□□ 1,67
Ap1s1P61967 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC25,47■■□□□ 1,67
Ap1s1P61967 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25,47■■□□□ 1,67
Ap1s1P61967 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,46■■□□□ 1,67
Ap1s1P61967 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,43■■□□□ 1,66
Ap1s1P61967 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25,43■■□□□ 1,66
Ap1s1P61967 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC25,43■■□□□ 1,66
Ap1s1P61967 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,42■■□□□ 1,66
Ap1s1P61967 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,41■■□□□ 1,66
Ap1s1P61967 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,4■■□□□ 1,66
Ap1s1P61967 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,39■■□□□ 1,65
Ap1s1P61967 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC25,38■■□□□ 1,65
Ap1s1P61967 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC25,37■■□□□ 1,65
Ap1s1P61967 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,37■■□□□ 1,65
Ap1s1P61967 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,36■■□□□ 1,65
Ap1s1P61967 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25,35■■□□□ 1,65
Ap1s1P61967 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,34■■□□□ 1,65
Ap1s1P61967 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC25,34■■□□□ 1,65
Ap1s1P61967 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,34■■□□□ 1,65
Ap1s1P61967 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,33■■□□□ 1,65
Ap1s1P61967 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,32■■□□□ 1,64
Ap1s1P61967 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25,31■■□□□ 1,64
Ap1s1P61967 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25,31■■□□□ 1,64
Ap1s1P61967 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,31■■□□□ 1,64
Ap1s1P61967 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC25,29■■□□□ 1,64
Ap1s1P61967 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC25,28■■□□□ 1,64
Ap1s1P61967 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,27■■□□□ 1,64
Ap1s1P61967 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25,27■■□□□ 1,64
Ap1s1P61967 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,26■■□□□ 1,63
Ap1s1P61967 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC25,26■■□□□ 1,63
Ap1s1P61967 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC25,25■■□□□ 1,63
Ap1s1P61967 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC25,25■■□□□ 1,63
Ap1s1P61967 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25,24■■□□□ 1,63
Ap1s1P61967 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC25,24■■□□□ 1,63
Ap1s1P61967 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC25,23■■□□□ 1,63
Ap1s1P61967 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC25,23■■□□□ 1,63
Ap1s1P61967 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,22■■□□□ 1,63
Ap1s1P61967 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC25,21■■□□□ 1,63
Ap1s1P61967 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC25,21■■□□□ 1,63
Ap1s1P61967 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC25,2■■□□□ 1,63
Ap1s1P61967 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25,2■■□□□ 1,63
Ap1s1P61967 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,2■■□□□ 1,62
Ap1s1P61967 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,19■■□□□ 1,62
Ap1s1P61967 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC25,19■■□□□ 1,62
Ap1s1P61967 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,19■■□□□ 1,62
Ap1s1P61967 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,19■■□□□ 1,62
Ap1s1P61967 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,18■■□□□ 1,62
Ap1s1P61967 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC25,18■■□□□ 1,62
Ap1s1P61967 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,17■■□□□ 1,62
Ap1s1P61967 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,16■■□□□ 1,62
Ap1s1P61967 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,15■■□□□ 1,62
Ap1s1P61967 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC25,15■■□□□ 1,62
Ap1s1P61967 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,15■■□□□ 1,62
Ap1s1P61967 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,15■■□□□ 1,62
Ap1s1P61967 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC25,14■■□□□ 1,62
Ap1s1P61967 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,13■■□□□ 1,61
Ap1s1P61967 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25,13■■□□□ 1,61
Ap1s1P61967 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC25,13■■□□□ 1,61
Ap1s1P61967 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,11■■□□□ 1,61
Ap1s1P61967 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,11■■□□□ 1,61
Ap1s1P61967 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC25,1■■□□□ 1,61
Ap1s1P61967 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC25,1■■□□□ 1,61
Ap1s1P61967 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,1■■□□□ 1,61
Ap1s1P61967 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC25,1■■□□□ 1,61
Ap1s1P61967 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,1■■□□□ 1,61
Ap1s1P61967 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC25,09■■□□□ 1,61
Ap1s1P61967 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,09■■□□□ 1,61
Ap1s1P61967 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC25,08■■□□□ 1,61
Ap1s1P61967 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC25,08■■□□□ 1,61
Ap1s1P61967 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,08■■□□□ 1,6
Ap1s1P61967 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,07■■□□□ 1,6
Ap1s1P61967 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC25,06■■□□□ 1,6
Ap1s1P61967 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,06■■□□□ 1,6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46,9 ms