Protein–RNA interactions for Protein: P61588

Rnd3, Rho-related GTP-binding protein RhoE, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnd3P61588 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,88■□□□□ 0,93
Rnd3P61588 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20,87■□□□□ 0,93
Rnd3P61588 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,87■□□□□ 0,93
Rnd3P61588 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC20,87■□□□□ 0,93
Rnd3P61588 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC20,86■□□□□ 0,93
Rnd3P61588 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20,85■□□□□ 0,93
Rnd3P61588 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC20,85■□□□□ 0,93
Rnd3P61588 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC20,85■□□□□ 0,93
Rnd3P61588 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20,84■□□□□ 0,93
Rnd3P61588 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC20,83■□□□□ 0,93
Rnd3P61588 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20,83■□□□□ 0,93
Rnd3P61588 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC20,82■□□□□ 0,92
Rnd3P61588 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC20,82■□□□□ 0,92
Rnd3P61588 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20,82■□□□□ 0,92
Rnd3P61588 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,82■□□□□ 0,92
Rnd3P61588 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC20,82■□□□□ 0,92
Rnd3P61588 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20,81■□□□□ 0,92
Rnd3P61588 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,81■□□□□ 0,92
Rnd3P61588 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20,8■□□□□ 0,92
Rnd3P61588 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20,8■□□□□ 0,92
Rnd3P61588 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20,8■□□□□ 0,92
Rnd3P61588 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC20,79■□□□□ 0,92
Rnd3P61588 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC20,79■□□□□ 0,92
Rnd3P61588 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20,79■□□□□ 0,92
Rnd3P61588 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC20,78■□□□□ 0,92
Rnd3P61588 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC20,78■□□□□ 0,92
Rnd3P61588 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20,77■□□□□ 0,92
Rnd3P61588 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC20,77■□□□□ 0,92
Rnd3P61588 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC20,77■□□□□ 0,92
Rnd3P61588 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC20,76■□□□□ 0,91
Rnd3P61588 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,76■□□□□ 0,91
Rnd3P61588 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,76■□□□□ 0,91
Rnd3P61588 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,75■□□□□ 0,91
Rnd3P61588 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC20,75■□□□□ 0,91
Rnd3P61588 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC20,75■□□□□ 0,91
Rnd3P61588 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20,74■□□□□ 0,91
Rnd3P61588 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC20,73■□□□□ 0,91
Rnd3P61588 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC20,73■□□□□ 0,91
Rnd3P61588 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,73■□□□□ 0,91
Rnd3P61588 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,72■□□□□ 0,91
Rnd3P61588 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20,72■□□□□ 0,91
Rnd3P61588 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,72■□□□□ 0,91
Rnd3P61588 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC20,7■□□□□ 0,9
Rnd3P61588 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20,7■□□□□ 0,9
Rnd3P61588 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC20,7■□□□□ 0,9
Rnd3P61588 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20,7■□□□□ 0,9
Rnd3P61588 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC20,7■□□□□ 0,9
Rnd3P61588 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,68■□□□□ 0,9
Rnd3P61588 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20,68■□□□□ 0,9
Rnd3P61588 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC20,68■□□□□ 0,9
Rnd3P61588 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC20,67■□□□□ 0,9
Rnd3P61588 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,67■□□□□ 0,9
Rnd3P61588 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20,67■□□□□ 0,9
Rnd3P61588 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20,66■□□□□ 0,9
Rnd3P61588 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20,65■□□□□ 0,9
Rnd3P61588 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,65■□□□□ 0,9
Rnd3P61588 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20,65■□□□□ 0,9
Rnd3P61588 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC20,65■□□□□ 0,9
Rnd3P61588 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC20,65■□□□□ 0,9
Rnd3P61588 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC20,64■□□□□ 0,9
Rnd3P61588 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,64■□□□□ 0,9
Rnd3P61588 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC20,64■□□□□ 0,9
Rnd3P61588 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,64■□□□□ 0,89
Rnd3P61588 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,64■□□□□ 0,89
Rnd3P61588 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,62■□□□□ 0,89
Rnd3P61588 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC20,61■□□□□ 0,89
Rnd3P61588 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20,6■□□□□ 0,89
Rnd3P61588 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,6■□□□□ 0,89
Rnd3P61588 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20,59■□□□□ 0,89
Rnd3P61588 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20,59■□□□□ 0,89
Rnd3P61588 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,59■□□□□ 0,89
Rnd3P61588 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC20,59■□□□□ 0,89
Rnd3P61588 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC20,59■□□□□ 0,89
Rnd3P61588 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20,59■□□□□ 0,89
Rnd3P61588 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20,58■□□□□ 0,88
Rnd3P61588 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,57■□□□□ 0,88
Rnd3P61588 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,57■□□□□ 0,88
Rnd3P61588 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20,57■□□□□ 0,88
Rnd3P61588 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20,57■□□□□ 0,88
Rnd3P61588 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,57■□□□□ 0,88
Rnd3P61588 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC20,56■□□□□ 0,88
Rnd3P61588 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,56■□□□□ 0,88
Rnd3P61588 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,56■□□□□ 0,88
Rnd3P61588 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,56■□□□□ 0,88
Rnd3P61588 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC20,55■□□□□ 0,88
Rnd3P61588 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20,54■□□□□ 0,88
Rnd3P61588 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20,54■□□□□ 0,88
Rnd3P61588 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC20,54■□□□□ 0,88
Rnd3P61588 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC20,54■□□□□ 0,88
Rnd3P61588 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20,53■□□□□ 0,88
Rnd3P61588 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,53■□□□□ 0,88
Rnd3P61588 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC20,51■□□□□ 0,87
Rnd3P61588 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC20,51■□□□□ 0,87
Rnd3P61588 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,5■□□□□ 0,87
Rnd3P61588 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC20,5■□□□□ 0,87
Rnd3P61588 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,49■□□□□ 0,87
Rnd3P61588 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20,49■□□□□ 0,87
Rnd3P61588 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20,47■□□□□ 0,87
Rnd3P61588 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,47■□□□□ 0,87
Rnd3P61588 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20,46■□□□□ 0,87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18,8 ms