Protein–RNA interactions for Protein: P61406

Smg6, Telomerase-binding protein EST1A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smg6P61406 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
Smg6P61406 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
Smg6P61406 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
Smg6P61406 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
Smg6P61406 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
Smg6P61406 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.27■■■■□ 3.24
Smg6P61406 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC35.27■■■■□ 3.24
Smg6P61406 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.24
Smg6P61406 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
Smg6P61406 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
Smg6P61406 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
Smg6P61406 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC35.19■■■■□ 3.22
Smg6P61406 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
Smg6P61406 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
Smg6P61406 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC35.17■■■■□ 3.22
Smg6P61406 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
Smg6P61406 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC35.15■■■■□ 3.22
Smg6P61406 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC35.14■■■■□ 3.22
Smg6P61406 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC35.11■■■■□ 3.21
Smg6P61406 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
Smg6P61406 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
Smg6P61406 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC35.06■■■■□ 3.2
Smg6P61406 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
Smg6P61406 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
Smg6P61406 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC35.04■■■■□ 3.2
Smg6P61406 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
Smg6P61406 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
Smg6P61406 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.01■■■■□ 3.2
Smg6P61406 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC35.01■■■■□ 3.2
Smg6P61406 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.01■■■■□ 3.19
Smg6P61406 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC35■■■■□ 3.19
Smg6P61406 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
Smg6P61406 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
Smg6P61406 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
Smg6P61406 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.99■■■■□ 3.19
Smg6P61406 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC34.98■■■■□ 3.19
Smg6P61406 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
Smg6P61406 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
Smg6P61406 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
Smg6P61406 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC34.96■■■■□ 3.19
Smg6P61406 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.95■■■■□ 3.19
Smg6P61406 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC34.91■■■■□ 3.18
Smg6P61406 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC34.9■■■■□ 3.18
Smg6P61406 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
Smg6P61406 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.86■■■■□ 3.17
Smg6P61406 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
Smg6P61406 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
Smg6P61406 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.85■■■■□ 3.17
Smg6P61406 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC34.85■■■■□ 3.17
Smg6P61406 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
Smg6P61406 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
Smg6P61406 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC34.84■■■■□ 3.17
Smg6P61406 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
Smg6P61406 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC34.83■■■■□ 3.17
Smg6P61406 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
Smg6P61406 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
Smg6P61406 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.17
Smg6P61406 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
Smg6P61406 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
Smg6P61406 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.79■■■■□ 3.16
Smg6P61406 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC34.78■■■■□ 3.16
Smg6P61406 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
Smg6P61406 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.15
Smg6P61406 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC34.75■■■■□ 3.15
Smg6P61406 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
Smg6P61406 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
Smg6P61406 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.75■■■■□ 3.15
Smg6P61406 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
Smg6P61406 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC34.74■■■■□ 3.15
Smg6P61406 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.73■■■■□ 3.15
Smg6P61406 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
Smg6P61406 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC34.71■■■■□ 3.15
Smg6P61406 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
Smg6P61406 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC34.69■■■■□ 3.14
Smg6P61406 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC34.69■■■■□ 3.14
Smg6P61406 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
Smg6P61406 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
Smg6P61406 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
Smg6P61406 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
Smg6P61406 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
Smg6P61406 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
Smg6P61406 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
Smg6P61406 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC34.63■■■■□ 3.13
Smg6P61406 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
Smg6P61406 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
Smg6P61406 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC34.61■■■■□ 3.13
Smg6P61406 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC34.6■■■■□ 3.13
Smg6P61406 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
Smg6P61406 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.58■■■■□ 3.13
Smg6P61406 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC34.58■■■■□ 3.13
Smg6P61406 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
Smg6P61406 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
Smg6P61406 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
Smg6P61406 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
Smg6P61406 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC34.55■■■■□ 3.12
Smg6P61406 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC34.55■■■■□ 3.12
Smg6P61406 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC34.55■■■■□ 3.12
Smg6P61406 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
Smg6P61406 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
Smg6P61406 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms