Protein–RNA interactions for Protein: P61358

Rpl27, 60S ribosomal protein L27, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl27P61358 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rpl27P61358 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rpl27P61358 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rpl27P61358 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Rpl27P61358 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rpl27P61358 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rpl27P61358 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rpl27P61358 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Rpl27P61358 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rpl27P61358 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rpl27P61358 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rpl27P61358 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rpl27P61358 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rpl27P61358 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Rpl27P61358 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Rpl27P61358 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rpl27P61358 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rpl27P61358 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rpl27P61358 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rpl27P61358 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Rpl27P61358 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rpl27P61358 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rpl27P61358 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rpl27P61358 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Rpl27P61358 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rpl27P61358 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Rpl27P61358 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rpl27P61358 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rpl27P61358 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Rpl27P61358 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rpl27P61358 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rpl27P61358 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rpl27P61358 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rpl27P61358 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rpl27P61358 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rpl27P61358 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rpl27P61358 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rpl27P61358 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rpl27P61358 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rpl27P61358 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rpl27P61358 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rpl27P61358 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rpl27P61358 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Rpl27P61358 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rpl27P61358 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rpl27P61358 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rpl27P61358 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rpl27P61358 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rpl27P61358 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rpl27P61358 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rpl27P61358 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rpl27P61358 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rpl27P61358 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rpl27P61358 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rpl27P61358 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rpl27P61358 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rpl27P61358 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rpl27P61358 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rpl27P61358 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rpl27P61358 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rpl27P61358 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rpl27P61358 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rpl27P61358 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rpl27P61358 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Rpl27P61358 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Rpl27P61358 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rpl27P61358 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rpl27P61358 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rpl27P61358 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rpl27P61358 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rpl27P61358 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rpl27P61358 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rpl27P61358 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rpl27P61358 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rpl27P61358 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rpl27P61358 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rpl27P61358 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rpl27P61358 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rpl27P61358 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rpl27P61358 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rpl27P61358 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rpl27P61358 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rpl27P61358 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rpl27P61358 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rpl27P61358 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Rpl27P61358 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rpl27P61358 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rpl27P61358 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rpl27P61358 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rpl27P61358 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rpl27P61358 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rpl27P61358 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rpl27P61358 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rpl27P61358 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rpl27P61358 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rpl27P61358 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rpl27P61358 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rpl27P61358 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rpl27P61358 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rpl27P61358 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.7 ms