Protein–RNA interactions for Protein: P61264

Stx1b, Syntaxin-1B, mousemouse

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx1bP61264 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Stx1bP61264 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Stx1bP61264 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Stx1bP61264 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Stx1bP61264 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Stx1bP61264 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Stx1bP61264 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Stx1bP61264 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Stx1bP61264 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Stx1bP61264 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Stx1bP61264 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Stx1bP61264 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Stx1bP61264 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Stx1bP61264 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Stx1bP61264 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Stx1bP61264 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Stx1bP61264 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Stx1bP61264 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Stx1bP61264 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Stx1bP61264 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Stx1bP61264 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Stx1bP61264 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Stx1bP61264 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Stx1bP61264 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Stx1bP61264 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Stx1bP61264 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Stx1bP61264 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Stx1bP61264 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Stx1bP61264 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Stx1bP61264 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Stx1bP61264 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Stx1bP61264 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Stx1bP61264 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Stx1bP61264 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Stx1bP61264 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Stx1bP61264 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Stx1bP61264 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Stx1bP61264 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Stx1bP61264 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Stx1bP61264 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Stx1bP61264 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Stx1bP61264 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Stx1bP61264 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Stx1bP61264 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Stx1bP61264 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Stx1bP61264 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Stx1bP61264 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Stx1bP61264 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Stx1bP61264 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Stx1bP61264 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Stx1bP61264 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Stx1bP61264 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Stx1bP61264 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Stx1bP61264 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Stx1bP61264 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Stx1bP61264 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Stx1bP61264 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Stx1bP61264 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Stx1bP61264 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Stx1bP61264 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Stx1bP61264 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Stx1bP61264 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Stx1bP61264 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Stx1bP61264 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Stx1bP61264 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Stx1bP61264 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Stx1bP61264 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Stx1bP61264 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Stx1bP61264 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Stx1bP61264 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Stx1bP61264 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Stx1bP61264 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Stx1bP61264 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Stx1bP61264 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Stx1bP61264 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Stx1bP61264 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Stx1bP61264 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Stx1bP61264 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Stx1bP61264 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Stx1bP61264 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Stx1bP61264 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Stx1bP61264 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Stx1bP61264 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Stx1bP61264 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Stx1bP61264 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Stx1bP61264 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Stx1bP61264 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Stx1bP61264 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Stx1bP61264 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Stx1bP61264 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Stx1bP61264 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Stx1bP61264 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Stx1bP61264 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Stx1bP61264 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Stx1bP61264 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Stx1bP61264 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Stx1bP61264 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Stx1bP61264 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Stx1bP61264 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
Stx1bP61264 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms