Protein–RNA interactions for Protein: P61089

Ube2n, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 N, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 152 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2nP61089 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ube2nP61089 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ube2nP61089 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ube2nP61089 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ube2nP61089 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ube2nP61089 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ube2nP61089 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ube2nP61089 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ube2nP61089 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ube2nP61089 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ube2nP61089 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ube2nP61089 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ube2nP61089 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ube2nP61089 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Ube2nP61089 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ube2nP61089 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ube2nP61089 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ube2nP61089 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ube2nP61089 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Ube2nP61089 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ube2nP61089 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ube2nP61089 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ube2nP61089 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ube2nP61089 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ube2nP61089 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ube2nP61089 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ube2nP61089 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ube2nP61089 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ube2nP61089 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ube2nP61089 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ube2nP61089 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ube2nP61089 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ube2nP61089 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ube2nP61089 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ube2nP61089 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ube2nP61089 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Ube2nP61089 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ube2nP61089 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ube2nP61089 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ube2nP61089 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ube2nP61089 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ube2nP61089 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ube2nP61089 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ube2nP61089 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ube2nP61089 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ube2nP61089 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ube2nP61089 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ube2nP61089 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ube2nP61089 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ube2nP61089 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ube2nP61089 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ube2nP61089 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Ube2nP61089 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ube2nP61089 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Ube2nP61089 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Ube2nP61089 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
Ube2nP61089 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ube2nP61089 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ube2nP61089 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ube2nP61089 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ube2nP61089 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ube2nP61089 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ube2nP61089 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ube2nP61089 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ube2nP61089 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Ube2nP61089 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ube2nP61089 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ube2nP61089 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ube2nP61089 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ube2nP61089 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Ube2nP61089 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ube2nP61089 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ube2nP61089 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ube2nP61089 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ube2nP61089 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ube2nP61089 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ube2nP61089 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ube2nP61089 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ube2nP61089 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ube2nP61089 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Ube2nP61089 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ube2nP61089 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ube2nP61089 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ube2nP61089 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ube2nP61089 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ube2nP61089 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ube2nP61089 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ube2nP61089 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ube2nP61089 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ube2nP61089 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ube2nP61089 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ube2nP61089 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ube2nP61089 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ube2nP61089 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ube2nP61089 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ube2nP61089 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ube2nP61089 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ube2nP61089 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ube2nP61089 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ube2nP61089 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.7 ms