Protein–RNA interactions for Protein: P61087

Ube2k, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 K, mousemouse

Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2kP61087 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Ube2kP61087 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ube2kP61087 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ube2kP61087 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ube2kP61087 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ube2kP61087 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ube2kP61087 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ube2kP61087 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ube2kP61087 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ube2kP61087 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ube2kP61087 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ube2kP61087 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ube2kP61087 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Ube2kP61087 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ube2kP61087 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Ube2kP61087 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ube2kP61087 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ube2kP61087 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ube2kP61087 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ube2kP61087 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ube2kP61087 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ube2kP61087 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ube2kP61087 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ube2kP61087 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ube2kP61087 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ube2kP61087 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ube2kP61087 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ube2kP61087 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
Ube2kP61087 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ube2kP61087 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ube2kP61087 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ube2kP61087 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ube2kP61087 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ube2kP61087 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ube2kP61087 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ube2kP61087 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ube2kP61087 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ube2kP61087 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ube2kP61087 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ube2kP61087 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ube2kP61087 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ube2kP61087 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ube2kP61087 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ube2kP61087 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ube2kP61087 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ube2kP61087 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ube2kP61087 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ube2kP61087 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ube2kP61087 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ube2kP61087 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ube2kP61087 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ube2kP61087 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ube2kP61087 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ube2kP61087 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ube2kP61087 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ube2kP61087 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ube2kP61087 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ube2kP61087 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ube2kP61087 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ube2kP61087 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ube2kP61087 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ube2kP61087 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ube2kP61087 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ube2kP61087 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Ube2kP61087 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ube2kP61087 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ube2kP61087 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Ube2kP61087 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ube2kP61087 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ube2kP61087 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ube2kP61087 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ube2kP61087 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ube2kP61087 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ube2kP61087 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Ube2kP61087 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ube2kP61087 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ube2kP61087 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ube2kP61087 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ube2kP61087 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ube2kP61087 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ube2kP61087 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ube2kP61087 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ube2kP61087 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ube2kP61087 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ube2kP61087 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ube2kP61087 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Ube2kP61087 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ube2kP61087 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ube2kP61087 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ube2kP61087 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ube2kP61087 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ube2kP61087 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ube2kP61087 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Ube2kP61087 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Ube2kP61087 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ube2kP61087 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ube2kP61087 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ube2kP61087 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ube2kP61087 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ube2kP61087 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.5 ms