Protein–RNA interactions for Protein: P59470

Polr3b, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC2, mousemouse

Predictions only

Length 1,133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr3bP59470 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Polr3bP59470 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Polr3bP59470 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Polr3bP59470 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Polr3bP59470 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Polr3bP59470 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Polr3bP59470 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Polr3bP59470 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Polr3bP59470 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Polr3bP59470 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Polr3bP59470 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Polr3bP59470 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Polr3bP59470 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Polr3bP59470 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Polr3bP59470 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Polr3bP59470 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC26■■□□□ 1.75
Polr3bP59470 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Polr3bP59470 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Polr3bP59470 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Polr3bP59470 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Polr3bP59470 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Polr3bP59470 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Polr3bP59470 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Polr3bP59470 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Polr3bP59470 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Polr3bP59470 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Polr3bP59470 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Polr3bP59470 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Polr3bP59470 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Polr3bP59470 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Polr3bP59470 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
Polr3bP59470 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Polr3bP59470 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Polr3bP59470 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Polr3bP59470 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Polr3bP59470 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Polr3bP59470 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
Polr3bP59470 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Polr3bP59470 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Polr3bP59470 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Polr3bP59470 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Polr3bP59470 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
Polr3bP59470 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Polr3bP59470 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Polr3bP59470 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
Polr3bP59470 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Polr3bP59470 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Polr3bP59470 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Polr3bP59470 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Polr3bP59470 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Polr3bP59470 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Polr3bP59470 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Polr3bP59470 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Polr3bP59470 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Polr3bP59470 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Polr3bP59470 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Polr3bP59470 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
Polr3bP59470 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Polr3bP59470 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Polr3bP59470 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Polr3bP59470 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Polr3bP59470 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Polr3bP59470 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Polr3bP59470 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Polr3bP59470 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Polr3bP59470 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Polr3bP59470 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Polr3bP59470 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Polr3bP59470 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Polr3bP59470 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Polr3bP59470 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Polr3bP59470 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Polr3bP59470 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Polr3bP59470 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
Polr3bP59470 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
Polr3bP59470 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
Polr3bP59470 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Polr3bP59470 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Polr3bP59470 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Polr3bP59470 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Polr3bP59470 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Polr3bP59470 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Polr3bP59470 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Polr3bP59470 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Polr3bP59470 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Polr3bP59470 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Polr3bP59470 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Polr3bP59470 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
Polr3bP59470 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Polr3bP59470 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Polr3bP59470 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
Polr3bP59470 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Polr3bP59470 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Polr3bP59470 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Polr3bP59470 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Polr3bP59470 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Polr3bP59470 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Polr3bP59470 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
Polr3bP59470 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Polr3bP59470 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.2 ms