Protein–RNA interactions for Protein: P59113

Fermt1, Fermitin family homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 677 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fermt1P59113 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Fermt1P59113 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Fermt1P59113 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Fermt1P59113 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Fermt1P59113 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Fermt1P59113 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Fermt1P59113 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Fermt1P59113 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
Fermt1P59113 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Fermt1P59113 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Fermt1P59113 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Fermt1P59113 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Fermt1P59113 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Fermt1P59113 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Fermt1P59113 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Fermt1P59113 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Fermt1P59113 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Fermt1P59113 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Fermt1P59113 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Fermt1P59113 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Fermt1P59113 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Fermt1P59113 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
Fermt1P59113 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Fermt1P59113 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Fermt1P59113 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Fermt1P59113 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Fermt1P59113 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
Fermt1P59113 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
Fermt1P59113 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Fermt1P59113 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Fermt1P59113 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Fermt1P59113 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
Fermt1P59113 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Fermt1P59113 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Fermt1P59113 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Fermt1P59113 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Fermt1P59113 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Fermt1P59113 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Fermt1P59113 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Fermt1P59113 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Fermt1P59113 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Fermt1P59113 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
Fermt1P59113 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Fermt1P59113 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
Fermt1P59113 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Fermt1P59113 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Fermt1P59113 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Fermt1P59113 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Fermt1P59113 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
Fermt1P59113 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Fermt1P59113 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Fermt1P59113 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Fermt1P59113 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Fermt1P59113 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Fermt1P59113 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
Fermt1P59113 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
Fermt1P59113 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Fermt1P59113 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Fermt1P59113 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
Fermt1P59113 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Fermt1P59113 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Fermt1P59113 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Fermt1P59113 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
Fermt1P59113 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Fermt1P59113 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Fermt1P59113 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Fermt1P59113 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Fermt1P59113 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Fermt1P59113 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Fermt1P59113 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Fermt1P59113 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Fermt1P59113 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Fermt1P59113 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Fermt1P59113 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Fermt1P59113 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Fermt1P59113 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Fermt1P59113 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Fermt1P59113 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Fermt1P59113 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Fermt1P59113 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Fermt1P59113 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Fermt1P59113 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Fermt1P59113 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Fermt1P59113 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Fermt1P59113 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Fermt1P59113 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Fermt1P59113 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Fermt1P59113 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Fermt1P59113 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Fermt1P59113 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Fermt1P59113 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Fermt1P59113 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Fermt1P59113 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Fermt1P59113 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Fermt1P59113 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Fermt1P59113 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Fermt1P59113 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Fermt1P59113 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Fermt1P59113 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Fermt1P59113 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms