Protein–RNA interactions for Protein: P58466

Ctdsp1, Carboxy-terminal domain RNA polymerase II polypeptide A small phosphatase 1, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdsp1P58466 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ctdsp1P58466 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ctdsp1P58466 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ctdsp1P58466 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ctdsp1P58466 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ctdsp1P58466 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ctdsp1P58466 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ctdsp1P58466 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ctdsp1P58466 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Ctdsp1P58466 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Ctdsp1P58466 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Ctdsp1P58466 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ctdsp1P58466 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
Ctdsp1P58466 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ctdsp1P58466 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ctdsp1P58466 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Ctdsp1P58466 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Ctdsp1P58466 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Ctdsp1P58466 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ctdsp1P58466 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ctdsp1P58466 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ctdsp1P58466 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ctdsp1P58466 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ctdsp1P58466 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ctdsp1P58466 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ctdsp1P58466 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ctdsp1P58466 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ctdsp1P58466 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ctdsp1P58466 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ctdsp1P58466 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ctdsp1P58466 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ctdsp1P58466 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC19.64■□□□□ 0.74
Ctdsp1P58466 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ctdsp1P58466 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ctdsp1P58466 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ctdsp1P58466 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ctdsp1P58466 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ctdsp1P58466 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ctdsp1P58466 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
Ctdsp1P58466 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ctdsp1P58466 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ctdsp1P58466 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ctdsp1P58466 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ctdsp1P58466 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ctdsp1P58466 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ctdsp1P58466 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Ctdsp1P58466 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ctdsp1P58466 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ctdsp1P58466 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ctdsp1P58466 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ctdsp1P58466 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ctdsp1P58466 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ctdsp1P58466 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ctdsp1P58466 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ctdsp1P58466 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ctdsp1P58466 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ctdsp1P58466 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ctdsp1P58466 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ctdsp1P58466 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ctdsp1P58466 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ctdsp1P58466 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ctdsp1P58466 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.71
Ctdsp1P58466 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ctdsp1P58466 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ctdsp1P58466 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ctdsp1P58466 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ctdsp1P58466 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ctdsp1P58466 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ctdsp1P58466 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Ctdsp1P58466 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ctdsp1P58466 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ctdsp1P58466 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ctdsp1P58466 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ctdsp1P58466 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ctdsp1P58466 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ctdsp1P58466 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ctdsp1P58466 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ctdsp1P58466 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ctdsp1P58466 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ctdsp1P58466 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ctdsp1P58466 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ctdsp1P58466 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ctdsp1P58466 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ctdsp1P58466 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ctdsp1P58466 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ctdsp1P58466 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ctdsp1P58466 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ctdsp1P58466 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ctdsp1P58466 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ctdsp1P58466 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ctdsp1P58466 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
Ctdsp1P58466 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Ctdsp1P58466 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Ctdsp1P58466 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Ctdsp1P58466 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Ctdsp1P58466 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Ctdsp1P58466 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Ctdsp1P58466 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Ctdsp1P58466 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Ctdsp1P58466 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.3 ms