Protein–RNA interactions for Protein: P58406

Hrh3, Histamine H3 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hrh3P58406 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Hrh3P58406 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Hrh3P58406 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Hrh3P58406 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Hrh3P58406 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Hrh3P58406 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Hrh3P58406 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Hrh3P58406 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Hrh3P58406 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Hrh3P58406 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Hrh3P58406 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Hrh3P58406 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Hrh3P58406 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Hrh3P58406 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Hrh3P58406 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Hrh3P58406 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Hrh3P58406 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Hrh3P58406 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Hrh3P58406 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Hrh3P58406 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Hrh3P58406 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Hrh3P58406 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Hrh3P58406 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Hrh3P58406 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Hrh3P58406 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Hrh3P58406 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Hrh3P58406 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Hrh3P58406 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Hrh3P58406 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Hrh3P58406 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Hrh3P58406 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Hrh3P58406 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Hrh3P58406 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Hrh3P58406 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Hrh3P58406 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Hrh3P58406 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Hrh3P58406 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Hrh3P58406 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Hrh3P58406 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Hrh3P58406 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Hrh3P58406 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Hrh3P58406 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Hrh3P58406 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Hrh3P58406 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Hrh3P58406 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Hrh3P58406 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Hrh3P58406 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Hrh3P58406 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Hrh3P58406 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Hrh3P58406 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Hrh3P58406 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Hrh3P58406 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Hrh3P58406 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Hrh3P58406 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Hrh3P58406 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Hrh3P58406 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Hrh3P58406 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Hrh3P58406 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Hrh3P58406 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Hrh3P58406 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Hrh3P58406 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Hrh3P58406 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Hrh3P58406 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Hrh3P58406 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Hrh3P58406 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Hrh3P58406 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Hrh3P58406 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Hrh3P58406 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Hrh3P58406 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Hrh3P58406 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Hrh3P58406 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Hrh3P58406 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Hrh3P58406 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Hrh3P58406 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Hrh3P58406 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Hrh3P58406 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Hrh3P58406 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Hrh3P58406 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Hrh3P58406 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Hrh3P58406 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Hrh3P58406 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Hrh3P58406 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Hrh3P58406 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Hrh3P58406 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Hrh3P58406 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Hrh3P58406 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Hrh3P58406 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Hrh3P58406 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Hrh3P58406 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Hrh3P58406 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Hrh3P58406 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Hrh3P58406 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Hrh3P58406 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Hrh3P58406 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Hrh3P58406 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Hrh3P58406 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Hrh3P58406 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Hrh3P58406 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Hrh3P58406 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Hrh3P58406 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.3 ms