Protein–RNA interactions for Protein: P57724

Pcbp4, Poly(rC)-binding protein 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 403 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcbp4P57724 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Pcbp4P57724 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Pcbp4P57724 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Pcbp4P57724 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Pcbp4P57724 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Pcbp4P57724 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Pcbp4P57724 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Pcbp4P57724 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Pcbp4P57724 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Pcbp4P57724 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Pcbp4P57724 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Pcbp4P57724 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Pcbp4P57724 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Pcbp4P57724 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Pcbp4P57724 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Pcbp4P57724 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Pcbp4P57724 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Pcbp4P57724 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Pcbp4P57724 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Pcbp4P57724 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Pcbp4P57724 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Pcbp4P57724 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Pcbp4P57724 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Pcbp4P57724 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Pcbp4P57724 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Pcbp4P57724 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Pcbp4P57724 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Pcbp4P57724 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Pcbp4P57724 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Pcbp4P57724 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Pcbp4P57724 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Pcbp4P57724 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Pcbp4P57724 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Pcbp4P57724 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Pcbp4P57724 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Pcbp4P57724 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Pcbp4P57724 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Pcbp4P57724 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Pcbp4P57724 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Pcbp4P57724 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Pcbp4P57724 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Pcbp4P57724 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Pcbp4P57724 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Pcbp4P57724 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Pcbp4P57724 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Pcbp4P57724 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Pcbp4P57724 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Pcbp4P57724 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Pcbp4P57724 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Pcbp4P57724 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Pcbp4P57724 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Pcbp4P57724 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Pcbp4P57724 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Pcbp4P57724 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Pcbp4P57724 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Pcbp4P57724 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Pcbp4P57724 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Pcbp4P57724 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Pcbp4P57724 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Pcbp4P57724 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Pcbp4P57724 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Pcbp4P57724 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Pcbp4P57724 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Pcbp4P57724 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Pcbp4P57724 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Pcbp4P57724 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Pcbp4P57724 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Pcbp4P57724 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Pcbp4P57724 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Pcbp4P57724 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Pcbp4P57724 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Pcbp4P57724 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Pcbp4P57724 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Pcbp4P57724 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Pcbp4P57724 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Pcbp4P57724 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Pcbp4P57724 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Pcbp4P57724 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Pcbp4P57724 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Pcbp4P57724 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Pcbp4P57724 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Pcbp4P57724 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Pcbp4P57724 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Pcbp4P57724 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Pcbp4P57724 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Pcbp4P57724 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Pcbp4P57724 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Pcbp4P57724 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Pcbp4P57724 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Pcbp4P57724 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Pcbp4P57724 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Pcbp4P57724 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Pcbp4P57724 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Pcbp4P57724 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Pcbp4P57724 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pcbp4P57724 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pcbp4P57724 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pcbp4P57724 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pcbp4P57724 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pcbp4P57724 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms