Protein–RNA interactions for Protein: P56812

Pdcd5, Programmed cell death protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdcd5P56812 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Pdcd5P56812 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Pdcd5P56812 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Pdcd5P56812 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Pdcd5P56812 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Pdcd5P56812 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Pdcd5P56812 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Pdcd5P56812 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Pdcd5P56812 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Pdcd5P56812 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Pdcd5P56812 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Pdcd5P56812 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Pdcd5P56812 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Pdcd5P56812 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Pdcd5P56812 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Pdcd5P56812 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Pdcd5P56812 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Pdcd5P56812 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Pdcd5P56812 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Pdcd5P56812 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Pdcd5P56812 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Pdcd5P56812 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Pdcd5P56812 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Pdcd5P56812 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Pdcd5P56812 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Pdcd5P56812 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Pdcd5P56812 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Pdcd5P56812 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pdcd5P56812 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pdcd5P56812 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pdcd5P56812 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pdcd5P56812 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pdcd5P56812 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pdcd5P56812 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pdcd5P56812 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pdcd5P56812 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pdcd5P56812 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Pdcd5P56812 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Pdcd5P56812 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pdcd5P56812 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pdcd5P56812 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pdcd5P56812 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pdcd5P56812 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Pdcd5P56812 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Pdcd5P56812 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pdcd5P56812 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Pdcd5P56812 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pdcd5P56812 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pdcd5P56812 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Pdcd5P56812 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pdcd5P56812 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pdcd5P56812 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pdcd5P56812 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Pdcd5P56812 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Pdcd5P56812 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Pdcd5P56812 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Pdcd5P56812 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Pdcd5P56812 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Pdcd5P56812 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Pdcd5P56812 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Pdcd5P56812 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Pdcd5P56812 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Pdcd5P56812 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Pdcd5P56812 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Pdcd5P56812 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Pdcd5P56812 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Pdcd5P56812 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Pdcd5P56812 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Pdcd5P56812 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Pdcd5P56812 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Pdcd5P56812 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Pdcd5P56812 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Pdcd5P56812 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Pdcd5P56812 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Pdcd5P56812 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Pdcd5P56812 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Pdcd5P56812 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Pdcd5P56812 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Pdcd5P56812 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Pdcd5P56812 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Pdcd5P56812 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Pdcd5P56812 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Pdcd5P56812 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Pdcd5P56812 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Pdcd5P56812 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Pdcd5P56812 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Pdcd5P56812 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Pdcd5P56812 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Pdcd5P56812 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Pdcd5P56812 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Pdcd5P56812 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Pdcd5P56812 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Pdcd5P56812 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Pdcd5P56812 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Pdcd5P56812 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Pdcd5P56812 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Pdcd5P56812 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Pdcd5P56812 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Pdcd5P56812 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Pdcd5P56812 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.8 ms