Protein–RNA interactions for Protein: P56393

Cox7b, Cytochrome c oxidase subunit 7B, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 80 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cox7bP56393 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cox7bP56393 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cox7bP56393 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Cox7bP56393 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cox7bP56393 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cox7bP56393 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Cox7bP56393 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cox7bP56393 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Cox7bP56393 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cox7bP56393 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cox7bP56393 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cox7bP56393 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cox7bP56393 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cox7bP56393 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cox7bP56393 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cox7bP56393 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cox7bP56393 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cox7bP56393 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cox7bP56393 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cox7bP56393 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cox7bP56393 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cox7bP56393 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cox7bP56393 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cox7bP56393 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cox7bP56393 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cox7bP56393 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cox7bP56393 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cox7bP56393 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cox7bP56393 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cox7bP56393 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cox7bP56393 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cox7bP56393 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cox7bP56393 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cox7bP56393 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cox7bP56393 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cox7bP56393 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cox7bP56393 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cox7bP56393 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cox7bP56393 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cox7bP56393 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cox7bP56393 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cox7bP56393 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cox7bP56393 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cox7bP56393 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cox7bP56393 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Cox7bP56393 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cox7bP56393 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cox7bP56393 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cox7bP56393 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cox7bP56393 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cox7bP56393 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cox7bP56393 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cox7bP56393 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cox7bP56393 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cox7bP56393 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cox7bP56393 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cox7bP56393 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cox7bP56393 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cox7bP56393 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cox7bP56393 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cox7bP56393 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cox7bP56393 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cox7bP56393 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cox7bP56393 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cox7bP56393 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cox7bP56393 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cox7bP56393 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cox7bP56393 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cox7bP56393 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cox7bP56393 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cox7bP56393 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cox7bP56393 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cox7bP56393 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cox7bP56393 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cox7bP56393 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cox7bP56393 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cox7bP56393 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cox7bP56393 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cox7bP56393 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cox7bP56393 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cox7bP56393 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cox7bP56393 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cox7bP56393 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cox7bP56393 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cox7bP56393 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cox7bP56393 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Cox7bP56393 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cox7bP56393 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cox7bP56393 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cox7bP56393 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cox7bP56393 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cox7bP56393 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cox7bP56393 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cox7bP56393 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cox7bP56393 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cox7bP56393 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cox7bP56393 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cox7bP56393 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cox7bP56393 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cox7bP56393 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.6 ms