Protein–RNA interactions for Protein: P55284

Cdh5, Cadherin-5, mousemouse

Predictions only

Length 784 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdh5P55284 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cdh5P55284 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Cdh5P55284 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Cdh5P55284 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Cdh5P55284 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cdh5P55284 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cdh5P55284 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cdh5P55284 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cdh5P55284 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cdh5P55284 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cdh5P55284 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cdh5P55284 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cdh5P55284 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cdh5P55284 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cdh5P55284 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cdh5P55284 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Cdh5P55284 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cdh5P55284 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cdh5P55284 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cdh5P55284 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
Cdh5P55284 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Cdh5P55284 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cdh5P55284 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cdh5P55284 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cdh5P55284 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cdh5P55284 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cdh5P55284 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Cdh5P55284 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cdh5P55284 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Cdh5P55284 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cdh5P55284 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Cdh5P55284 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cdh5P55284 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cdh5P55284 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cdh5P55284 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Cdh5P55284 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Cdh5P55284 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Cdh5P55284 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cdh5P55284 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cdh5P55284 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cdh5P55284 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cdh5P55284 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cdh5P55284 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cdh5P55284 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Cdh5P55284 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Cdh5P55284 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Cdh5P55284 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cdh5P55284 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cdh5P55284 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cdh5P55284 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cdh5P55284 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cdh5P55284 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cdh5P55284 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cdh5P55284 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cdh5P55284 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cdh5P55284 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cdh5P55284 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cdh5P55284 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cdh5P55284 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cdh5P55284 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.43
Cdh5P55284 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cdh5P55284 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cdh5P55284 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Cdh5P55284 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Cdh5P55284 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cdh5P55284 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Cdh5P55284 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cdh5P55284 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cdh5P55284 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cdh5P55284 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Cdh5P55284 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Cdh5P55284 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Cdh5P55284 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Cdh5P55284 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Cdh5P55284 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cdh5P55284 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cdh5P55284 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Cdh5P55284 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Cdh5P55284 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Cdh5P55284 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cdh5P55284 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Cdh5P55284 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cdh5P55284 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cdh5P55284 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Cdh5P55284 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cdh5P55284 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cdh5P55284 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cdh5P55284 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Cdh5P55284 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Cdh5P55284 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cdh5P55284 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Cdh5P55284 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Cdh5P55284 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Cdh5P55284 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Cdh5P55284 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Cdh5P55284 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Cdh5P55284 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Cdh5P55284 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Cdh5P55284 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Cdh5P55284 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.2 ms