Protein–RNA interactions for Protein: P55098

Pex2, Peroxisome biogenesis factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pex2P55098 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Pex2P55098 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Pex2P55098 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Pex2P55098 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Pex2P55098 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Pex2P55098 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Pex2P55098 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Pex2P55098 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Pex2P55098 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Pex2P55098 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Pex2P55098 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Pex2P55098 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Pex2P55098 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Pex2P55098 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Pex2P55098 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Pex2P55098 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Pex2P55098 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Pex2P55098 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Pex2P55098 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Pex2P55098 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Pex2P55098 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Pex2P55098 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Pex2P55098 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Pex2P55098 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Pex2P55098 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Pex2P55098 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Pex2P55098 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Pex2P55098 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Pex2P55098 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Pex2P55098 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Pex2P55098 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Pex2P55098 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Pex2P55098 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Pex2P55098 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Pex2P55098 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Pex2P55098 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Pex2P55098 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Pex2P55098 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Pex2P55098 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Pex2P55098 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Pex2P55098 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Pex2P55098 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Pex2P55098 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Pex2P55098 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Pex2P55098 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Pex2P55098 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
Pex2P55098 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Pex2P55098 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Pex2P55098 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Pex2P55098 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Pex2P55098 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Pex2P55098 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Pex2P55098 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Pex2P55098 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Pex2P55098 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Pex2P55098 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Pex2P55098 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Pex2P55098 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Pex2P55098 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Pex2P55098 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Pex2P55098 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Pex2P55098 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
Pex2P55098 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Pex2P55098 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Pex2P55098 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Pex2P55098 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Pex2P55098 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Pex2P55098 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Pex2P55098 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Pex2P55098 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Pex2P55098 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Pex2P55098 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Pex2P55098 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Pex2P55098 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Pex2P55098 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Pex2P55098 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Pex2P55098 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Pex2P55098 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Pex2P55098 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Pex2P55098 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Pex2P55098 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Pex2P55098 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Pex2P55098 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Pex2P55098 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Pex2P55098 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Pex2P55098 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Pex2P55098 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Pex2P55098 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Pex2P55098 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Pex2P55098 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Pex2P55098 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Pex2P55098 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Pex2P55098 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Pex2P55098 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Pex2P55098 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Pex2P55098 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Pex2P55098 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Pex2P55098 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Pex2P55098 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Pex2P55098 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 164 ms