Protein–RNA interactions for Protein: P54775

Psmc4, 26S proteasome regulatory subunit 6B, mousemouse

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmc4P54775 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC29.35■■■□□ 2.29
Psmc4P54775 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
Psmc4P54775 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Psmc4P54775 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Psmc4P54775 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Psmc4P54775 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Psmc4P54775 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Psmc4P54775 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Psmc4P54775 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Psmc4P54775 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Psmc4P54775 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Psmc4P54775 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Psmc4P54775 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Psmc4P54775 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
Psmc4P54775 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.27
Psmc4P54775 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
Psmc4P54775 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Psmc4P54775 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Psmc4P54775 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Psmc4P54775 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Psmc4P54775 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Psmc4P54775 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Psmc4P54775 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Psmc4P54775 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Psmc4P54775 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Psmc4P54775 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
Psmc4P54775 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Psmc4P54775 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
Psmc4P54775 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
Psmc4P54775 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Psmc4P54775 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Psmc4P54775 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Psmc4P54775 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Psmc4P54775 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Psmc4P54775 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Psmc4P54775 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Psmc4P54775 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Psmc4P54775 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Psmc4P54775 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Psmc4P54775 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Psmc4P54775 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Psmc4P54775 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Psmc4P54775 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
Psmc4P54775 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
Psmc4P54775 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Psmc4P54775 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Psmc4P54775 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Psmc4P54775 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Psmc4P54775 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Psmc4P54775 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Psmc4P54775 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Psmc4P54775 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Psmc4P54775 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
Psmc4P54775 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Psmc4P54775 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Psmc4P54775 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Psmc4P54775 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Psmc4P54775 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Psmc4P54775 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Psmc4P54775 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Psmc4P54775 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Psmc4P54775 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Psmc4P54775 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Psmc4P54775 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Psmc4P54775 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Psmc4P54775 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Psmc4P54775 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Psmc4P54775 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Psmc4P54775 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC28.76■■■□□ 2.2
Psmc4P54775 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Psmc4P54775 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Psmc4P54775 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Psmc4P54775 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Psmc4P54775 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Psmc4P54775 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Psmc4P54775 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Psmc4P54775 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Psmc4P54775 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
Psmc4P54775 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Psmc4P54775 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Psmc4P54775 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Psmc4P54775 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Psmc4P54775 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Psmc4P54775 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Psmc4P54775 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
Psmc4P54775 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Psmc4P54775 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Psmc4P54775 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Psmc4P54775 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Psmc4P54775 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Psmc4P54775 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
Psmc4P54775 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Psmc4P54775 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Psmc4P54775 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Psmc4P54775 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Psmc4P54775 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Psmc4P54775 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Psmc4P54775 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Psmc4P54775 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Psmc4P54775 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms