Protein–RNA interactions for Protein: P54761

Ephb4, Ephrin type-B receptor 4, mousemouse

Predictions only

Length 987 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ephb4P54761 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
Ephb4P54761 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Ephb4P54761 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Ephb4P54761 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Ephb4P54761 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Ephb4P54761 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Ephb4P54761 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Ephb4P54761 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Ephb4P54761 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
Ephb4P54761 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
Ephb4P54761 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Ephb4P54761 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
Ephb4P54761 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Ephb4P54761 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Ephb4P54761 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Ephb4P54761 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Ephb4P54761 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Ephb4P54761 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Ephb4P54761 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Ephb4P54761 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
Ephb4P54761 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Ephb4P54761 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Ephb4P54761 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
Ephb4P54761 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Ephb4P54761 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Ephb4P54761 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Ephb4P54761 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Ephb4P54761 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Ephb4P54761 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Ephb4P54761 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Ephb4P54761 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Ephb4P54761 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Ephb4P54761 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Ephb4P54761 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Ephb4P54761 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Ephb4P54761 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Ephb4P54761 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.08
Ephb4P54761 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Ephb4P54761 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Ephb4P54761 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
Ephb4P54761 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Ephb4P54761 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Ephb4P54761 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Ephb4P54761 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Ephb4P54761 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
Ephb4P54761 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Ephb4P54761 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Ephb4P54761 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Ephb4P54761 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Ephb4P54761 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Ephb4P54761 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Ephb4P54761 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
Ephb4P54761 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Ephb4P54761 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Ephb4P54761 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Ephb4P54761 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Ephb4P54761 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Ephb4P54761 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Ephb4P54761 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Ephb4P54761 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Ephb4P54761 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Ephb4P54761 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Ephb4P54761 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Ephb4P54761 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
Ephb4P54761 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Ephb4P54761 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Ephb4P54761 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Ephb4P54761 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Ephb4P54761 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Ephb4P54761 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Ephb4P54761 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Ephb4P54761 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Ephb4P54761 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Ephb4P54761 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
Ephb4P54761 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Ephb4P54761 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Ephb4P54761 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Ephb4P54761 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
Ephb4P54761 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
Ephb4P54761 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
Ephb4P54761 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Ephb4P54761 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Ephb4P54761 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Ephb4P54761 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Ephb4P54761 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Ephb4P54761 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Ephb4P54761 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Ephb4P54761 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Ephb4P54761 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Ephb4P54761 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Ephb4P54761 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Ephb4P54761 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Ephb4P54761 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Ephb4P54761 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Ephb4P54761 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Ephb4P54761 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Ephb4P54761 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
Ephb4P54761 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Ephb4P54761 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Ephb4P54761 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.5 ms