Protein–RNA interactions for Protein: P54726

Rad23a, UV excision repair protein RAD23 homolog A, mousemouse

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad23aP54726 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Rad23aP54726 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Rad23aP54726 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Rad23aP54726 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Rad23aP54726 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Rad23aP54726 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Rad23aP54726 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Rad23aP54726 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Rad23aP54726 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Rad23aP54726 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Rad23aP54726 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
Rad23aP54726 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Rad23aP54726 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Rad23aP54726 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Rad23aP54726 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Rad23aP54726 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Rad23aP54726 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Rad23aP54726 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Rad23aP54726 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Rad23aP54726 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Rad23aP54726 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Rad23aP54726 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Rad23aP54726 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Rad23aP54726 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Rad23aP54726 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Rad23aP54726 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Rad23aP54726 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Rad23aP54726 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Rad23aP54726 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Rad23aP54726 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Rad23aP54726 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Rad23aP54726 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Rad23aP54726 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Rad23aP54726 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Rad23aP54726 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Rad23aP54726 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Rad23aP54726 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Rad23aP54726 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC27.01■■□□□ 1.92
Rad23aP54726 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Rad23aP54726 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Rad23aP54726 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Rad23aP54726 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Rad23aP54726 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
Rad23aP54726 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC27■■□□□ 1.91
Rad23aP54726 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Rad23aP54726 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Rad23aP54726 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Rad23aP54726 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Rad23aP54726 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Rad23aP54726 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Rad23aP54726 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Rad23aP54726 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Rad23aP54726 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Rad23aP54726 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Rad23aP54726 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Rad23aP54726 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Rad23aP54726 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Rad23aP54726 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Rad23aP54726 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Rad23aP54726 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Rad23aP54726 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Rad23aP54726 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Rad23aP54726 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Rad23aP54726 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Rad23aP54726 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Rad23aP54726 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Rad23aP54726 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
Rad23aP54726 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Rad23aP54726 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Rad23aP54726 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Rad23aP54726 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Rad23aP54726 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Rad23aP54726 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
Rad23aP54726 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Rad23aP54726 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Rad23aP54726 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Rad23aP54726 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Rad23aP54726 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
Rad23aP54726 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Rad23aP54726 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Rad23aP54726 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Rad23aP54726 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Rad23aP54726 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Rad23aP54726 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Rad23aP54726 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Rad23aP54726 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Rad23aP54726 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Rad23aP54726 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Rad23aP54726 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Rad23aP54726 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Rad23aP54726 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Rad23aP54726 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Rad23aP54726 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Rad23aP54726 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Rad23aP54726 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Rad23aP54726 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Rad23aP54726 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
Rad23aP54726 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Rad23aP54726 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Rad23aP54726 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.6 ms