Protein–RNA interactions for Protein: P52793

Efna1, Ephrin-A1, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efna1P52793 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
Efna1P52793 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Efna1P52793 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Efna1P52793 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Efna1P52793 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Efna1P52793 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Efna1P52793 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Efna1P52793 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Efna1P52793 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Efna1P52793 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Efna1P52793 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Efna1P52793 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Efna1P52793 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Efna1P52793 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Efna1P52793 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Efna1P52793 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Efna1P52793 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Efna1P52793 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Efna1P52793 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Efna1P52793 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Efna1P52793 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Efna1P52793 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Efna1P52793 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Efna1P52793 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Efna1P52793 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Efna1P52793 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Efna1P52793 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Efna1P52793 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Efna1P52793 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Efna1P52793 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Efna1P52793 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Efna1P52793 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Efna1P52793 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Efna1P52793 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Efna1P52793 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Efna1P52793 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Efna1P52793 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Efna1P52793 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Efna1P52793 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Efna1P52793 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Efna1P52793 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Efna1P52793 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Efna1P52793 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Efna1P52793 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Efna1P52793 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Efna1P52793 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Efna1P52793 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Efna1P52793 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Efna1P52793 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Efna1P52793 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Efna1P52793 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Efna1P52793 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Efna1P52793 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Efna1P52793 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Efna1P52793 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Efna1P52793 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Efna1P52793 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Efna1P52793 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Efna1P52793 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Efna1P52793 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Efna1P52793 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Efna1P52793 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Efna1P52793 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Efna1P52793 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Efna1P52793 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Efna1P52793 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Efna1P52793 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Efna1P52793 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Efna1P52793 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Efna1P52793 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Efna1P52793 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Efna1P52793 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Efna1P52793 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Efna1P52793 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Efna1P52793 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Efna1P52793 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Efna1P52793 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Efna1P52793 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Efna1P52793 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Efna1P52793 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Efna1P52793 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Efna1P52793 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Efna1P52793 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Efna1P52793 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Efna1P52793 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Efna1P52793 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Efna1P52793 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Efna1P52793 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Efna1P52793 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Efna1P52793 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Efna1P52793 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Efna1P52793 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Efna1P52793 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Efna1P52793 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Efna1P52793 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Efna1P52793 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Efna1P52793 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Efna1P52793 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Efna1P52793 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Efna1P52793 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 89.5 ms