Protein–RNA interactions for Protein: P52734

Fgd1, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 960 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fgd1P52734 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,11■■■□□ 2,73
Fgd1P52734 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,09■■■□□ 2,73
Fgd1P52734 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC32,09■■■□□ 2,73
Fgd1P52734 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC32,07■■■□□ 2,72
Fgd1P52734 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32,06■■■□□ 2,72
Fgd1P52734 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC32,06■■■□□ 2,72
Fgd1P52734 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,06■■■□□ 2,72
Fgd1P52734 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32,05■■■□□ 2,72
Fgd1P52734 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32,05■■■□□ 2,72
Fgd1P52734 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC32,04■■■□□ 2,72
Fgd1P52734 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,04■■■□□ 2,72
Fgd1P52734 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,03■■■□□ 2,72
Fgd1P52734 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,03■■■□□ 2,72
Fgd1P52734 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC32,01■■■□□ 2,72
Fgd1P52734 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,01■■■□□ 2,71
Fgd1P52734 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,01■■■□□ 2,71
Fgd1P52734 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,97■■■□□ 2,71
Fgd1P52734 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC31,96■■■□□ 2,71
Fgd1P52734 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,96■■■□□ 2,71
Fgd1P52734 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,96■■■□□ 2,71
Fgd1P52734 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31,95■■■□□ 2,71
Fgd1P52734 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31,95■■■□□ 2,71
Fgd1P52734 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC31,95■■■□□ 2,71
Fgd1P52734 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC31,94■■■□□ 2,7
Fgd1P52734 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,93■■■□□ 2,7
Fgd1P52734 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC31,92■■■□□ 2,7
Fgd1P52734 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC31,91■■■□□ 2,7
Fgd1P52734 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31,91■■■□□ 2,7
Fgd1P52734 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,89■■■□□ 2,7
Fgd1P52734 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,87■■■□□ 2,69
Fgd1P52734 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31,87■■■□□ 2,69
Fgd1P52734 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC31,87■■■□□ 2,69
Fgd1P52734 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,87■■■□□ 2,69
Fgd1P52734 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31,84■■■□□ 2,69
Fgd1P52734 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC31,84■■■□□ 2,69
Fgd1P52734 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC31,84■■■□□ 2,69
Fgd1P52734 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,84■■■□□ 2,69
Fgd1P52734 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC31,83■■■□□ 2,69
Fgd1P52734 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31,83■■■□□ 2,69
Fgd1P52734 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC31,83■■■□□ 2,69
Fgd1P52734 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31,83■■■□□ 2,69
Fgd1P52734 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,81■■■□□ 2,68
Fgd1P52734 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC31,81■■■□□ 2,68
Fgd1P52734 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31,81■■■□□ 2,68
Fgd1P52734 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,79■■■□□ 2,68
Fgd1P52734 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,79■■■□□ 2,68
Fgd1P52734 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31,78■■■□□ 2,68
Fgd1P52734 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC31,78■■■□□ 2,68
Fgd1P52734 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,77■■■□□ 2,68
Fgd1P52734 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,77■■■□□ 2,68
Fgd1P52734 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC31,77■■■□□ 2,68
Fgd1P52734 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31,76■■■□□ 2,68
Fgd1P52734 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,76■■■□□ 2,68
Fgd1P52734 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,74■■■□□ 2,67
Fgd1P52734 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31,73■■■□□ 2,67
Fgd1P52734 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC31,73■■■□□ 2,67
Fgd1P52734 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC31,72■■■□□ 2,67
Fgd1P52734 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31,71■■■□□ 2,67
Fgd1P52734 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC31,71■■■□□ 2,67
Fgd1P52734 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC31,7■■■□□ 2,67
Fgd1P52734 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC31,69■■■□□ 2,66
Fgd1P52734 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,69■■■□□ 2,66
Fgd1P52734 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,69■■■□□ 2,66
Fgd1P52734 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC31,67■■■□□ 2,66
Fgd1P52734 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,67■■■□□ 2,66
Fgd1P52734 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC31,66■■■□□ 2,66
Fgd1P52734 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC31,66■■■□□ 2,66
Fgd1P52734 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC31,65■■■□□ 2,66
Fgd1P52734 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC31,64■■■□□ 2,66
Fgd1P52734 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,63■■■□□ 2,65
Fgd1P52734 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC31,62■■■□□ 2,65
Fgd1P52734 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC31,62■■■□□ 2,65
Fgd1P52734 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31,61■■■□□ 2,65
Fgd1P52734 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,61■■■□□ 2,65
Fgd1P52734 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC31,6■■■□□ 2,65
Fgd1P52734 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31,6■■■□□ 2,65
Fgd1P52734 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC31,6■■■□□ 2,65
Fgd1P52734 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,59■■■□□ 2,65
Fgd1P52734 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31,58■■■□□ 2,65
Fgd1P52734 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31,58■■■□□ 2,65
Fgd1P52734 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,57■■■□□ 2,65
Fgd1P52734 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,57■■■□□ 2,64
Fgd1P52734 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,57■■■□□ 2,64
Fgd1P52734 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC31,57■■■□□ 2,64
Fgd1P52734 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC31,56■■■□□ 2,64
Fgd1P52734 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31,55■■■□□ 2,64
Fgd1P52734 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC31,53■■■□□ 2,64
Fgd1P52734 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31,53■■■□□ 2,64
Fgd1P52734 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31,52■■■□□ 2,64
Fgd1P52734 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC31,52■■■□□ 2,64
Fgd1P52734 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31,51■■■□□ 2,64
Fgd1P52734 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,51■■■□□ 2,63
Fgd1P52734 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,48■■■□□ 2,63
Fgd1P52734 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC31,47■■■□□ 2,63
Fgd1P52734 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31,47■■■□□ 2,63
Fgd1P52734 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,47■■■□□ 2,63
Fgd1P52734 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31,46■■■□□ 2,63
Fgd1P52734 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,44■■■□□ 2,62
Fgd1P52734 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31,43■■■□□ 2,62
Fgd1P52734 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC31,43■■■□□ 2,62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26,3 ms