Protein–RNA interactions for Protein: P51944

Ccnf, Cyclin-F, mousemouse

Predictions only

Length 777 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CcnfP51944 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CcnfP51944 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CcnfP51944 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CcnfP51944 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CcnfP51944 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CcnfP51944 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CcnfP51944 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CcnfP51944 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CcnfP51944 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CcnfP51944 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
CcnfP51944 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CcnfP51944 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CcnfP51944 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CcnfP51944 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CcnfP51944 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CcnfP51944 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CcnfP51944 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CcnfP51944 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CcnfP51944 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CcnfP51944 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CcnfP51944 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CcnfP51944 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CcnfP51944 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CcnfP51944 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CcnfP51944 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CcnfP51944 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CcnfP51944 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CcnfP51944 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CcnfP51944 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CcnfP51944 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CcnfP51944 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CcnfP51944 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
CcnfP51944 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CcnfP51944 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CcnfP51944 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CcnfP51944 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CcnfP51944 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CcnfP51944 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CcnfP51944 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CcnfP51944 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CcnfP51944 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CcnfP51944 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CcnfP51944 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CcnfP51944 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CcnfP51944 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CcnfP51944 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CcnfP51944 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CcnfP51944 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CcnfP51944 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CcnfP51944 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CcnfP51944 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CcnfP51944 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CcnfP51944 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CcnfP51944 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CcnfP51944 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CcnfP51944 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CcnfP51944 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CcnfP51944 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
CcnfP51944 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CcnfP51944 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.43
CcnfP51944 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
CcnfP51944 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CcnfP51944 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CcnfP51944 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CcnfP51944 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CcnfP51944 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CcnfP51944 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CcnfP51944 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CcnfP51944 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CcnfP51944 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CcnfP51944 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CcnfP51944 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CcnfP51944 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CcnfP51944 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CcnfP51944 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CcnfP51944 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CcnfP51944 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CcnfP51944 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CcnfP51944 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CcnfP51944 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CcnfP51944 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CcnfP51944 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
CcnfP51944 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CcnfP51944 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CcnfP51944 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CcnfP51944 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CcnfP51944 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CcnfP51944 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CcnfP51944 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CcnfP51944 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CcnfP51944 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CcnfP51944 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CcnfP51944 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CcnfP51944 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CcnfP51944 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CcnfP51944 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CcnfP51944 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CcnfP51944 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CcnfP51944 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CcnfP51944 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.3 ms