Protein–RNA interactions for Protein: P50571

Gabrb1, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabrb1P50571 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gabrb1P50571 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gabrb1P50571 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gabrb1P50571 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gabrb1P50571 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gabrb1P50571 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gabrb1P50571 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gabrb1P50571 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gabrb1P50571 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gabrb1P50571 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gabrb1P50571 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gabrb1P50571 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gabrb1P50571 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gabrb1P50571 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gabrb1P50571 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gabrb1P50571 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gabrb1P50571 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gabrb1P50571 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gabrb1P50571 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gabrb1P50571 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gabrb1P50571 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gabrb1P50571 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gabrb1P50571 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gabrb1P50571 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gabrb1P50571 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gabrb1P50571 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gabrb1P50571 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gabrb1P50571 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gabrb1P50571 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gabrb1P50571 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gabrb1P50571 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gabrb1P50571 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gabrb1P50571 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gabrb1P50571 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gabrb1P50571 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Gabrb1P50571 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gabrb1P50571 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gabrb1P50571 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gabrb1P50571 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gabrb1P50571 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gabrb1P50571 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gabrb1P50571 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gabrb1P50571 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gabrb1P50571 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gabrb1P50571 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gabrb1P50571 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gabrb1P50571 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gabrb1P50571 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gabrb1P50571 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gabrb1P50571 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gabrb1P50571 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gabrb1P50571 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gabrb1P50571 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gabrb1P50571 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gabrb1P50571 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gabrb1P50571 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gabrb1P50571 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gabrb1P50571 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gabrb1P50571 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gabrb1P50571 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gabrb1P50571 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gabrb1P50571 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gabrb1P50571 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Gabrb1P50571 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gabrb1P50571 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gabrb1P50571 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gabrb1P50571 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gabrb1P50571 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gabrb1P50571 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gabrb1P50571 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gabrb1P50571 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gabrb1P50571 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gabrb1P50571 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gabrb1P50571 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gabrb1P50571 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Gabrb1P50571 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Gabrb1P50571 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gabrb1P50571 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gabrb1P50571 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gabrb1P50571 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gabrb1P50571 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gabrb1P50571 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gabrb1P50571 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gabrb1P50571 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gabrb1P50571 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gabrb1P50571 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gabrb1P50571 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gabrb1P50571 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gabrb1P50571 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Gabrb1P50571 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gabrb1P50571 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gabrb1P50571 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Gabrb1P50571 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gabrb1P50571 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gabrb1P50571 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gabrb1P50571 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gabrb1P50571 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gabrb1P50571 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gabrb1P50571 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gabrb1P50571 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.7 ms