Protein–RNA interactions for Protein: P48678

Lmna, Prelamin-A/C, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LmnaP48678 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
LmnaP48678 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
LmnaP48678 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
LmnaP48678 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
LmnaP48678 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
LmnaP48678 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
LmnaP48678 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
LmnaP48678 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
LmnaP48678 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
LmnaP48678 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
LmnaP48678 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
LmnaP48678 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
LmnaP48678 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
LmnaP48678 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
LmnaP48678 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
LmnaP48678 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
LmnaP48678 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
LmnaP48678 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
LmnaP48678 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
LmnaP48678 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
LmnaP48678 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
LmnaP48678 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
LmnaP48678 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
LmnaP48678 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
LmnaP48678 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
LmnaP48678 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
LmnaP48678 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
LmnaP48678 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
LmnaP48678 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
LmnaP48678 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
LmnaP48678 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
LmnaP48678 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.72
LmnaP48678 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
LmnaP48678 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
LmnaP48678 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
LmnaP48678 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
LmnaP48678 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
LmnaP48678 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
LmnaP48678 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
LmnaP48678 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
LmnaP48678 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
LmnaP48678 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
LmnaP48678 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
LmnaP48678 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
LmnaP48678 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
LmnaP48678 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
LmnaP48678 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
LmnaP48678 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
LmnaP48678 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
LmnaP48678 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
LmnaP48678 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
LmnaP48678 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
LmnaP48678 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
LmnaP48678 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
LmnaP48678 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
LmnaP48678 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
LmnaP48678 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
LmnaP48678 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
LmnaP48678 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
LmnaP48678 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
LmnaP48678 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
LmnaP48678 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
LmnaP48678 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
LmnaP48678 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
LmnaP48678 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
LmnaP48678 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
LmnaP48678 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
LmnaP48678 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
LmnaP48678 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
LmnaP48678 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
LmnaP48678 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
LmnaP48678 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
LmnaP48678 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
LmnaP48678 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
LmnaP48678 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
LmnaP48678 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
LmnaP48678 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
LmnaP48678 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
LmnaP48678 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
LmnaP48678 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
LmnaP48678 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LmnaP48678 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LmnaP48678 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
LmnaP48678 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
LmnaP48678 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
LmnaP48678 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
LmnaP48678 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
LmnaP48678 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
LmnaP48678 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
LmnaP48678 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
LmnaP48678 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
LmnaP48678 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
LmnaP48678 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
LmnaP48678 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
LmnaP48678 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
LmnaP48678 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
LmnaP48678 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
LmnaP48678 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
LmnaP48678 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
LmnaP48678 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.1 ms