Protein–RNA interactions for Protein: P47806

Gli1, Zinc finger protein GLI1, mousemouse

Predictions only

Length 1,111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gli1P47806 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Gli1P47806 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Gli1P47806 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Gli1P47806 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Gli1P47806 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Gli1P47806 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Gli1P47806 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Gli1P47806 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Gli1P47806 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Gli1P47806 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Gli1P47806 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Gli1P47806 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gli1P47806 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Gli1P47806 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Gli1P47806 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Gli1P47806 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Gli1P47806 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Gli1P47806 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Gli1P47806 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Gli1P47806 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Gli1P47806 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Gli1P47806 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Gli1P47806 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Gli1P47806 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Gli1P47806 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Gli1P47806 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Gli1P47806 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Gli1P47806 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Gli1P47806 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Gli1P47806 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Gli1P47806 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Gli1P47806 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Gli1P47806 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Gli1P47806 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Gli1P47806 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Gli1P47806 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Gli1P47806 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Gli1P47806 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Gli1P47806 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Gli1P47806 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Gli1P47806 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Gli1P47806 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Gli1P47806 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Gli1P47806 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Gli1P47806 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Gli1P47806 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Gli1P47806 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Gli1P47806 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Gli1P47806 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Gli1P47806 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Gli1P47806 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Gli1P47806 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Gli1P47806 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Gli1P47806 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Gli1P47806 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Gli1P47806 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Gli1P47806 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Gli1P47806 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Gli1P47806 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Gli1P47806 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Gli1P47806 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Gli1P47806 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Gli1P47806 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Gli1P47806 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Gli1P47806 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Gli1P47806 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Gli1P47806 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Gli1P47806 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Gli1P47806 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Gli1P47806 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Gli1P47806 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Gli1P47806 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Gli1P47806 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Gli1P47806 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Gli1P47806 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
Gli1P47806 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
Gli1P47806 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Gli1P47806 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Gli1P47806 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Gli1P47806 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Gli1P47806 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Gli1P47806 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Gli1P47806 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Gli1P47806 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Gli1P47806 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Gli1P47806 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Gli1P47806 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Gli1P47806 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Gli1P47806 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Gli1P47806 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Gli1P47806 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Gli1P47806 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Gli1P47806 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Gli1P47806 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Gli1P47806 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Gli1P47806 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Gli1P47806 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Gli1P47806 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Gli1P47806 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Gli1P47806 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.9 ms