Protein–RNA interactions for Protein: P47708

Rph3a, Rabphilin-3A, mousemouse

Predictions only

Length 681 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rph3aP47708 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Rph3aP47708 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Rph3aP47708 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rph3aP47708 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Rph3aP47708 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rph3aP47708 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rph3aP47708 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rph3aP47708 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rph3aP47708 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Rph3aP47708 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Rph3aP47708 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rph3aP47708 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rph3aP47708 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rph3aP47708 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rph3aP47708 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rph3aP47708 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rph3aP47708 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rph3aP47708 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rph3aP47708 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rph3aP47708 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rph3aP47708 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rph3aP47708 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rph3aP47708 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Rph3aP47708 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Rph3aP47708 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rph3aP47708 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rph3aP47708 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rph3aP47708 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rph3aP47708 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rph3aP47708 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rph3aP47708 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rph3aP47708 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rph3aP47708 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rph3aP47708 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Rph3aP47708 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Rph3aP47708 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Rph3aP47708 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rph3aP47708 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rph3aP47708 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Rph3aP47708 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Rph3aP47708 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Rph3aP47708 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rph3aP47708 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rph3aP47708 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rph3aP47708 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Rph3aP47708 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Rph3aP47708 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Rph3aP47708 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Rph3aP47708 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Rph3aP47708 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Rph3aP47708 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Rph3aP47708 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Rph3aP47708 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Rph3aP47708 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Rph3aP47708 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Rph3aP47708 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Rph3aP47708 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Rph3aP47708 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Rph3aP47708 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Rph3aP47708 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Rph3aP47708 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Rph3aP47708 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Rph3aP47708 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Rph3aP47708 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Rph3aP47708 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Rph3aP47708 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Rph3aP47708 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Rph3aP47708 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Rph3aP47708 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Rph3aP47708 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Rph3aP47708 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Rph3aP47708 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Rph3aP47708 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Rph3aP47708 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Rph3aP47708 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Rph3aP47708 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Rph3aP47708 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Rph3aP47708 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Rph3aP47708 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Rph3aP47708 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Rph3aP47708 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Rph3aP47708 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Rph3aP47708 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Rph3aP47708 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Rph3aP47708 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Rph3aP47708 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Rph3aP47708 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Rph3aP47708 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Rph3aP47708 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Rph3aP47708 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Rph3aP47708 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Rph3aP47708 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Rph3aP47708 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Rph3aP47708 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Rph3aP47708 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Rph3aP47708 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Rph3aP47708 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Rph3aP47708 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Rph3aP47708 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Rph3aP47708 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.2 ms