Protein–RNA interactions for Protein: P46684

Zic1, Zinc finger protein ZIC 1, mousemouse

Predictions only

Length 447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zic1P46684 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Zic1P46684 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Zic1P46684 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Zic1P46684 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Zic1P46684 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Zic1P46684 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Zic1P46684 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Zic1P46684 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Zic1P46684 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Zic1P46684 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Zic1P46684 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Zic1P46684 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Zic1P46684 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Zic1P46684 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Zic1P46684 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Zic1P46684 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Zic1P46684 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Zic1P46684 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Zic1P46684 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Zic1P46684 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Zic1P46684 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Zic1P46684 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Zic1P46684 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Zic1P46684 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Zic1P46684 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Zic1P46684 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Zic1P46684 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Zic1P46684 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Zic1P46684 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Zic1P46684 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Zic1P46684 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Zic1P46684 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Zic1P46684 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Zic1P46684 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Zic1P46684 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Zic1P46684 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Zic1P46684 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Zic1P46684 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Zic1P46684 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Zic1P46684 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Zic1P46684 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Zic1P46684 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Zic1P46684 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Zic1P46684 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Zic1P46684 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Zic1P46684 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Zic1P46684 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Zic1P46684 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Zic1P46684 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Zic1P46684 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Zic1P46684 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Zic1P46684 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Zic1P46684 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Zic1P46684 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Zic1P46684 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Zic1P46684 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Zic1P46684 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Zic1P46684 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Zic1P46684 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Zic1P46684 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Zic1P46684 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Zic1P46684 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Zic1P46684 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Zic1P46684 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Zic1P46684 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Zic1P46684 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Zic1P46684 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Zic1P46684 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Zic1P46684 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Zic1P46684 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Zic1P46684 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Zic1P46684 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Zic1P46684 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Zic1P46684 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Zic1P46684 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Zic1P46684 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Zic1P46684 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Zic1P46684 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Zic1P46684 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Zic1P46684 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Zic1P46684 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Zic1P46684 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Zic1P46684 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Zic1P46684 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Zic1P46684 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Zic1P46684 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Zic1P46684 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Zic1P46684 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Zic1P46684 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Zic1P46684 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Zic1P46684 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Zic1P46684 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Zic1P46684 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Zic1P46684 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Zic1P46684 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Zic1P46684 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Zic1P46684 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Zic1P46684 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Zic1P46684 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Zic1P46684 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 97.9 ms