Protein–RNA interactions for Protein: P46414

Cdkn1b, Cyclin-dependent kinase inhibitor 1B, mousemouse

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkn1bP46414 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cdkn1bP46414 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cdkn1bP46414 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cdkn1bP46414 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cdkn1bP46414 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cdkn1bP46414 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cdkn1bP46414 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Cdkn1bP46414 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cdkn1bP46414 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cdkn1bP46414 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cdkn1bP46414 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cdkn1bP46414 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cdkn1bP46414 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cdkn1bP46414 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cdkn1bP46414 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cdkn1bP46414 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cdkn1bP46414 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cdkn1bP46414 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cdkn1bP46414 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Cdkn1bP46414 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Cdkn1bP46414 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cdkn1bP46414 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cdkn1bP46414 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cdkn1bP46414 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cdkn1bP46414 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cdkn1bP46414 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cdkn1bP46414 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cdkn1bP46414 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cdkn1bP46414 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cdkn1bP46414 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cdkn1bP46414 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cdkn1bP46414 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cdkn1bP46414 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Cdkn1bP46414 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cdkn1bP46414 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cdkn1bP46414 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cdkn1bP46414 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cdkn1bP46414 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cdkn1bP46414 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cdkn1bP46414 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cdkn1bP46414 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cdkn1bP46414 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cdkn1bP46414 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cdkn1bP46414 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cdkn1bP46414 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cdkn1bP46414 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Cdkn1bP46414 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Cdkn1bP46414 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cdkn1bP46414 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cdkn1bP46414 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Cdkn1bP46414 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cdkn1bP46414 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cdkn1bP46414 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cdkn1bP46414 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Cdkn1bP46414 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cdkn1bP46414 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cdkn1bP46414 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cdkn1bP46414 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Cdkn1bP46414 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cdkn1bP46414 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cdkn1bP46414 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Cdkn1bP46414 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cdkn1bP46414 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cdkn1bP46414 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cdkn1bP46414 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cdkn1bP46414 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cdkn1bP46414 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cdkn1bP46414 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Cdkn1bP46414 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cdkn1bP46414 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cdkn1bP46414 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cdkn1bP46414 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cdkn1bP46414 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cdkn1bP46414 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cdkn1bP46414 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cdkn1bP46414 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cdkn1bP46414 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cdkn1bP46414 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cdkn1bP46414 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cdkn1bP46414 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cdkn1bP46414 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cdkn1bP46414 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cdkn1bP46414 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Cdkn1bP46414 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Cdkn1bP46414 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cdkn1bP46414 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Cdkn1bP46414 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cdkn1bP46414 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cdkn1bP46414 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cdkn1bP46414 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cdkn1bP46414 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cdkn1bP46414 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cdkn1bP46414 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cdkn1bP46414 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cdkn1bP46414 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cdkn1bP46414 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cdkn1bP46414 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cdkn1bP46414 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cdkn1bP46414 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cdkn1bP46414 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.9 ms