Protein–RNA interactions for Protein: P46099

Klf1, Krueppel-like factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf1P46099 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Klf1P46099 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Klf1P46099 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Klf1P46099 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Klf1P46099 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Klf1P46099 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
Klf1P46099 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Klf1P46099 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
Klf1P46099 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Klf1P46099 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
Klf1P46099 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Klf1P46099 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Klf1P46099 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Klf1P46099 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
Klf1P46099 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Klf1P46099 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Klf1P46099 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Klf1P46099 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Klf1P46099 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Klf1P46099 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Klf1P46099 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Klf1P46099 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Klf1P46099 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Klf1P46099 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Klf1P46099 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Klf1P46099 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Klf1P46099 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Klf1P46099 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Klf1P46099 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Klf1P46099 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Klf1P46099 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Klf1P46099 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Klf1P46099 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Klf1P46099 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Klf1P46099 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Klf1P46099 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Klf1P46099 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Klf1P46099 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Klf1P46099 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Klf1P46099 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Klf1P46099 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Klf1P46099 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Klf1P46099 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
Klf1P46099 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Klf1P46099 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Klf1P46099 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Klf1P46099 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Klf1P46099 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Klf1P46099 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Klf1P46099 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
Klf1P46099 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Klf1P46099 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Klf1P46099 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Klf1P46099 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Klf1P46099 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
Klf1P46099 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
Klf1P46099 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Klf1P46099 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Klf1P46099 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Klf1P46099 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Klf1P46099 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Klf1P46099 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Klf1P46099 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Klf1P46099 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Klf1P46099 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Klf1P46099 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Klf1P46099 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Klf1P46099 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
Klf1P46099 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Klf1P46099 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Klf1P46099 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
Klf1P46099 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Klf1P46099 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Klf1P46099 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Klf1P46099 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
Klf1P46099 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Klf1P46099 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Klf1P46099 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Klf1P46099 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
Klf1P46099 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Klf1P46099 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Klf1P46099 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Klf1P46099 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Klf1P46099 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Klf1P46099 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
Klf1P46099 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Klf1P46099 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Klf1P46099 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
Klf1P46099 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Klf1P46099 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Klf1P46099 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Klf1P46099 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Klf1P46099 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Klf1P46099 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Klf1P46099 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Klf1P46099 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Klf1P46099 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Klf1P46099 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Klf1P46099 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Klf1P46099 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.5 ms