Protein–RNA interactions for Protein: P39038

Cdh4, Cadherin-4, mousemouse

Predictions only

Length 913 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdh4P39038 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cdh4P39038 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cdh4P39038 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cdh4P39038 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cdh4P39038 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cdh4P39038 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cdh4P39038 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cdh4P39038 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Cdh4P39038 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cdh4P39038 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cdh4P39038 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cdh4P39038 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cdh4P39038 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cdh4P39038 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cdh4P39038 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cdh4P39038 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cdh4P39038 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cdh4P39038 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cdh4P39038 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cdh4P39038 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cdh4P39038 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cdh4P39038 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Cdh4P39038 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Cdh4P39038 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Cdh4P39038 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cdh4P39038 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cdh4P39038 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cdh4P39038 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Cdh4P39038 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cdh4P39038 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cdh4P39038 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Cdh4P39038 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Cdh4P39038 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cdh4P39038 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cdh4P39038 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cdh4P39038 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cdh4P39038 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cdh4P39038 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cdh4P39038 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Cdh4P39038 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cdh4P39038 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cdh4P39038 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Cdh4P39038 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Cdh4P39038 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Cdh4P39038 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cdh4P39038 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Cdh4P39038 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Cdh4P39038 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Cdh4P39038 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cdh4P39038 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cdh4P39038 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cdh4P39038 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cdh4P39038 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Cdh4P39038 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Cdh4P39038 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Cdh4P39038 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Cdh4P39038 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Cdh4P39038 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Cdh4P39038 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cdh4P39038 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Cdh4P39038 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Cdh4P39038 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Cdh4P39038 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Cdh4P39038 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Cdh4P39038 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Cdh4P39038 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cdh4P39038 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Cdh4P39038 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cdh4P39038 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cdh4P39038 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cdh4P39038 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cdh4P39038 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Cdh4P39038 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Cdh4P39038 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Cdh4P39038 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Cdh4P39038 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Cdh4P39038 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Cdh4P39038 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Cdh4P39038 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Cdh4P39038 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Cdh4P39038 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Cdh4P39038 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Cdh4P39038 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Cdh4P39038 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Cdh4P39038 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Cdh4P39038 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Cdh4P39038 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Cdh4P39038 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Cdh4P39038 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Cdh4P39038 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Cdh4P39038 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Cdh4P39038 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Cdh4P39038 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cdh4P39038 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cdh4P39038 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cdh4P39038 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cdh4P39038 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cdh4P39038 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cdh4P39038 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cdh4P39038 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.1 ms