Protein–RNA interactions for Protein: P37242

Thrb, Thyroid hormone receptor beta, mousemouse

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ThrbP37242 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ThrbP37242 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ThrbP37242 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ThrbP37242 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ThrbP37242 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ThrbP37242 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ThrbP37242 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ThrbP37242 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ThrbP37242 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ThrbP37242 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
ThrbP37242 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
ThrbP37242 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ThrbP37242 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ThrbP37242 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
ThrbP37242 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ThrbP37242 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ThrbP37242 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
ThrbP37242 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ThrbP37242 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
ThrbP37242 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
ThrbP37242 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ThrbP37242 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ThrbP37242 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ThrbP37242 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ThrbP37242 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ThrbP37242 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ThrbP37242 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ThrbP37242 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ThrbP37242 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ThrbP37242 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
ThrbP37242 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ThrbP37242 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ThrbP37242 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ThrbP37242 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ThrbP37242 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ThrbP37242 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ThrbP37242 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ThrbP37242 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
ThrbP37242 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
ThrbP37242 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ThrbP37242 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ThrbP37242 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ThrbP37242 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ThrbP37242 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ThrbP37242 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ThrbP37242 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ThrbP37242 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ThrbP37242 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ThrbP37242 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ThrbP37242 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ThrbP37242 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ThrbP37242 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ThrbP37242 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ThrbP37242 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ThrbP37242 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ThrbP37242 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ThrbP37242 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ThrbP37242 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ThrbP37242 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ThrbP37242 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ThrbP37242 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ThrbP37242 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ThrbP37242 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ThrbP37242 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ThrbP37242 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ThrbP37242 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ThrbP37242 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ThrbP37242 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ThrbP37242 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ThrbP37242 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ThrbP37242 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ThrbP37242 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ThrbP37242 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ThrbP37242 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ThrbP37242 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ThrbP37242 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ThrbP37242 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ThrbP37242 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ThrbP37242 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ThrbP37242 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ThrbP37242 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ThrbP37242 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ThrbP37242 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ThrbP37242 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ThrbP37242 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ThrbP37242 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ThrbP37242 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ThrbP37242 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ThrbP37242 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ThrbP37242 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ThrbP37242 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ThrbP37242 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ThrbP37242 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ThrbP37242 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ThrbP37242 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ThrbP37242 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ThrbP37242 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ThrbP37242 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ThrbP37242 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ThrbP37242 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.7 ms