Protein–RNA interactions for Protein: P33174

Kif4, Chromosome-associated kinesin KIF4, mousemouse

Predictions only

Length 1,231 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kif4P33174 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
Kif4P33174 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Kif4P33174 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Kif4P33174 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Kif4P33174 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Kif4P33174 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Kif4P33174 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Kif4P33174 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Kif4P33174 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.24
Kif4P33174 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Kif4P33174 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Kif4P33174 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Kif4P33174 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Kif4P33174 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Kif4P33174 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Kif4P33174 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Kif4P33174 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Kif4P33174 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Kif4P33174 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Kif4P33174 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Kif4P33174 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Kif4P33174 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Kif4P33174 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Kif4P33174 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Kif4P33174 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Kif4P33174 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Kif4P33174 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Kif4P33174 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC28.89■■■□□ 2.21
Kif4P33174 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Kif4P33174 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Kif4P33174 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Kif4P33174 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Kif4P33174 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Kif4P33174 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Kif4P33174 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Kif4P33174 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Kif4P33174 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Kif4P33174 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Kif4P33174 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Kif4P33174 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Kif4P33174 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Kif4P33174 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Kif4P33174 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Kif4P33174 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Kif4P33174 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Kif4P33174 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Kif4P33174 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Kif4P33174 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Kif4P33174 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Kif4P33174 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Kif4P33174 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Kif4P33174 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Kif4P33174 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Kif4P33174 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Kif4P33174 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Kif4P33174 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Kif4P33174 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Kif4P33174 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Kif4P33174 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Kif4P33174 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Kif4P33174 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Kif4P33174 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Kif4P33174 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Kif4P33174 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Kif4P33174 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Kif4P33174 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Kif4P33174 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Kif4P33174 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Kif4P33174 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Kif4P33174 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Kif4P33174 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Kif4P33174 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Kif4P33174 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Kif4P33174 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Kif4P33174 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Kif4P33174 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Kif4P33174 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Kif4P33174 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Kif4P33174 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Kif4P33174 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Kif4P33174 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Kif4P33174 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Kif4P33174 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Kif4P33174 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
Kif4P33174 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Kif4P33174 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
Kif4P33174 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Kif4P33174 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Kif4P33174 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
Kif4P33174 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Kif4P33174 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Kif4P33174 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Kif4P33174 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Kif4P33174 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Kif4P33174 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Kif4P33174 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Kif4P33174 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Kif4P33174 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Kif4P33174 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Kif4P33174 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.4 ms