Protein–RNA interactions for Protein: P31313

Hoxc11, Homeobox protein Hox-C11, mousemouse

Predictions only

Length 304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc11P31313 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Hoxc11P31313 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Hoxc11P31313 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Hoxc11P31313 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Hoxc11P31313 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Hoxc11P31313 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Hoxc11P31313 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Hoxc11P31313 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Hoxc11P31313 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Hoxc11P31313 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Hoxc11P31313 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Hoxc11P31313 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Hoxc11P31313 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Hoxc11P31313 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Hoxc11P31313 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Hoxc11P31313 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Hoxc11P31313 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Hoxc11P31313 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Hoxc11P31313 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Hoxc11P31313 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Hoxc11P31313 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Hoxc11P31313 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Hoxc11P31313 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Hoxc11P31313 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Hoxc11P31313 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Hoxc11P31313 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Hoxc11P31313 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Hoxc11P31313 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Hoxc11P31313 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Hoxc11P31313 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Hoxc11P31313 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Hoxc11P31313 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Hoxc11P31313 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Hoxc11P31313 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Hoxc11P31313 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Hoxc11P31313 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Hoxc11P31313 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Hoxc11P31313 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Hoxc11P31313 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Hoxc11P31313 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Hoxc11P31313 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Hoxc11P31313 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Hoxc11P31313 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Hoxc11P31313 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Hoxc11P31313 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Hoxc11P31313 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Hoxc11P31313 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Hoxc11P31313 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Hoxc11P31313 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Hoxc11P31313 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Hoxc11P31313 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Hoxc11P31313 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Hoxc11P31313 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Hoxc11P31313 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Hoxc11P31313 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Hoxc11P31313 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Hoxc11P31313 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Hoxc11P31313 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Hoxc11P31313 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Hoxc11P31313 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Hoxc11P31313 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Hoxc11P31313 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Hoxc11P31313 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Hoxc11P31313 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Hoxc11P31313 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Hoxc11P31313 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Hoxc11P31313 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Hoxc11P31313 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Hoxc11P31313 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Hoxc11P31313 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Hoxc11P31313 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Hoxc11P31313 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Hoxc11P31313 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Hoxc11P31313 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Hoxc11P31313 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Hoxc11P31313 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Hoxc11P31313 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Hoxc11P31313 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Hoxc11P31313 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Hoxc11P31313 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Hoxc11P31313 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Hoxc11P31313 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Hoxc11P31313 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Hoxc11P31313 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Hoxc11P31313 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Hoxc11P31313 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Hoxc11P31313 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Hoxc11P31313 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Hoxc11P31313 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Hoxc11P31313 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Hoxc11P31313 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Hoxc11P31313 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Hoxc11P31313 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Hoxc11P31313 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Hoxc11P31313 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Hoxc11P31313 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Hoxc11P31313 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
Hoxc11P31313 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Hoxc11P31313 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Hoxc11P31313 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 213 ms