Protein–RNA interactions for Protein: P30285

Cdk4, Cyclin-dependent kinase 4, mousemouse

Predictions only

Length 303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk4P30285 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
Cdk4P30285 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
Cdk4P30285 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Cdk4P30285 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Cdk4P30285 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Cdk4P30285 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Cdk4P30285 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Cdk4P30285 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Cdk4P30285 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Cdk4P30285 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Cdk4P30285 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Cdk4P30285 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Cdk4P30285 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Cdk4P30285 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Cdk4P30285 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Cdk4P30285 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Cdk4P30285 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Cdk4P30285 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Cdk4P30285 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Cdk4P30285 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Cdk4P30285 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Cdk4P30285 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Cdk4P30285 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Cdk4P30285 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Cdk4P30285 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Cdk4P30285 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Cdk4P30285 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Cdk4P30285 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Cdk4P30285 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Cdk4P30285 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Cdk4P30285 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Cdk4P30285 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Cdk4P30285 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Cdk4P30285 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Cdk4P30285 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
Cdk4P30285 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Cdk4P30285 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Cdk4P30285 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Cdk4P30285 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Cdk4P30285 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Cdk4P30285 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
Cdk4P30285 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Cdk4P30285 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Cdk4P30285 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Cdk4P30285 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Cdk4P30285 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Cdk4P30285 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Cdk4P30285 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Cdk4P30285 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Cdk4P30285 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Cdk4P30285 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Cdk4P30285 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
Cdk4P30285 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Cdk4P30285 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Cdk4P30285 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Cdk4P30285 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Cdk4P30285 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Cdk4P30285 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Cdk4P30285 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Cdk4P30285 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Cdk4P30285 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC27.53■■■□□ 2
Cdk4P30285 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC27.53■■■□□ 2
Cdk4P30285 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Cdk4P30285 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Cdk4P30285 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Cdk4P30285 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Cdk4P30285 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Cdk4P30285 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Cdk4P30285 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Cdk4P30285 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Cdk4P30285 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Cdk4P30285 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Cdk4P30285 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Cdk4P30285 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Cdk4P30285 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC27.45■■□□□ 1.99
Cdk4P30285 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Cdk4P30285 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Cdk4P30285 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Cdk4P30285 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Cdk4P30285 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Cdk4P30285 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Cdk4P30285 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Cdk4P30285 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Cdk4P30285 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Cdk4P30285 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Cdk4P30285 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Cdk4P30285 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Cdk4P30285 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Cdk4P30285 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Cdk4P30285 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Cdk4P30285 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Cdk4P30285 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
Cdk4P30285 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Cdk4P30285 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Cdk4P30285 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Cdk4P30285 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Cdk4P30285 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Cdk4P30285 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Cdk4P30285 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Cdk4P30285 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.2 ms