Protein–RNA interactions for Protein: P28705

Rxrg, Retinoic acid receptor RXR-gamma, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxrgP28705 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RxrgP28705 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RxrgP28705 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RxrgP28705 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RxrgP28705 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RxrgP28705 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RxrgP28705 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RxrgP28705 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RxrgP28705 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RxrgP28705 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RxrgP28705 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RxrgP28705 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RxrgP28705 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RxrgP28705 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RxrgP28705 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RxrgP28705 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RxrgP28705 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RxrgP28705 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RxrgP28705 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RxrgP28705 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
RxrgP28705 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
RxrgP28705 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RxrgP28705 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RxrgP28705 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RxrgP28705 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RxrgP28705 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RxrgP28705 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
RxrgP28705 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RxrgP28705 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RxrgP28705 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RxrgP28705 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RxrgP28705 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RxrgP28705 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
RxrgP28705 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
RxrgP28705 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RxrgP28705 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RxrgP28705 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RxrgP28705 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RxrgP28705 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
RxrgP28705 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RxrgP28705 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
RxrgP28705 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RxrgP28705 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RxrgP28705 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RxrgP28705 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RxrgP28705 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RxrgP28705 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RxrgP28705 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RxrgP28705 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RxrgP28705 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RxrgP28705 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RxrgP28705 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RxrgP28705 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RxrgP28705 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RxrgP28705 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RxrgP28705 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RxrgP28705 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
RxrgP28705 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
RxrgP28705 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RxrgP28705 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RxrgP28705 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
RxrgP28705 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RxrgP28705 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RxrgP28705 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RxrgP28705 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RxrgP28705 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RxrgP28705 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RxrgP28705 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RxrgP28705 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
RxrgP28705 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RxrgP28705 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RxrgP28705 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RxrgP28705 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RxrgP28705 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
RxrgP28705 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RxrgP28705 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RxrgP28705 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RxrgP28705 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RxrgP28705 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RxrgP28705 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RxrgP28705 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RxrgP28705 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RxrgP28705 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RxrgP28705 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
RxrgP28705 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RxrgP28705 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RxrgP28705 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
RxrgP28705 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RxrgP28705 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RxrgP28705 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RxrgP28705 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
RxrgP28705 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
RxrgP28705 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
RxrgP28705 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
RxrgP28705 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RxrgP28705 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RxrgP28705 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
RxrgP28705 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RxrgP28705 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RxrgP28705 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.7 ms