Protein–RNA interactions for Protein: P28704

Rxrb, Retinoic acid receptor RXR-beta, mousemouse

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxrbP28704 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC25,65■■□□□ 1,7
RxrbP28704 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC25,64■■□□□ 1,7
RxrbP28704 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25,62■■□□□ 1,69
RxrbP28704 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC25,62■■□□□ 1,69
RxrbP28704 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC25,61■■□□□ 1,69
RxrbP28704 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25,61■■□□□ 1,69
RxrbP28704 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,61■■□□□ 1,69
RxrbP28704 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC25,61■■□□□ 1,69
RxrbP28704 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,6■■□□□ 1,69
RxrbP28704 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,6■■□□□ 1,69
RxrbP28704 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC25,59■■□□□ 1,69
RxrbP28704 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,58■■□□□ 1,69
RxrbP28704 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25,58■■□□□ 1,68
RxrbP28704 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC25,57■■□□□ 1,68
RxrbP28704 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,57■■□□□ 1,68
RxrbP28704 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,55■■□□□ 1,68
RxrbP28704 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC25,55■■□□□ 1,68
RxrbP28704 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,55■■□□□ 1,68
RxrbP28704 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25,54■■□□□ 1,68
RxrbP28704 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,54■■□□□ 1,68
RxrbP28704 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25,53■■□□□ 1,68
RxrbP28704 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,53■■□□□ 1,68
RxrbP28704 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,52■■□□□ 1,68
RxrbP28704 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC25,52■■□□□ 1,68
RxrbP28704 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,49■■□□□ 1,67
RxrbP28704 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25,49■■□□□ 1,67
RxrbP28704 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,49■■□□□ 1,67
RxrbP28704 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC25,48■■□□□ 1,67
RxrbP28704 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,46■■□□□ 1,67
RxrbP28704 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,46■■□□□ 1,67
RxrbP28704 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25,46■■□□□ 1,67
RxrbP28704 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC25,45■■□□□ 1,66
RxrbP28704 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25,44■■□□□ 1,66
RxrbP28704 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,43■■□□□ 1,66
RxrbP28704 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC25,43■■□□□ 1,66
RxrbP28704 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC25,43■■□□□ 1,66
RxrbP28704 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25,41■■□□□ 1,66
RxrbP28704 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC25,4■■□□□ 1,66
RxrbP28704 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,4■■□□□ 1,66
RxrbP28704 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,39■■□□□ 1,66
RxrbP28704 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25,38■■□□□ 1,65
RxrbP28704 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25,38■■□□□ 1,65
RxrbP28704 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,38■■□□□ 1,65
RxrbP28704 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25,37■■□□□ 1,65
RxrbP28704 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,37■■□□□ 1,65
RxrbP28704 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,37■■□□□ 1,65
RxrbP28704 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25,35■■□□□ 1,65
RxrbP28704 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25,34■■□□□ 1,65
RxrbP28704 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC25,34■■□□□ 1,65
RxrbP28704 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,34■■□□□ 1,65
RxrbP28704 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,33■■□□□ 1,65
RxrbP28704 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,32■■□□□ 1,64
RxrbP28704 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25,32■■□□□ 1,64
RxrbP28704 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC25,32■■□□□ 1,64
RxrbP28704 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC25,31■■□□□ 1,64
RxrbP28704 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC25,31■■□□□ 1,64
RxrbP28704 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,3■■□□□ 1,64
RxrbP28704 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,3■■□□□ 1,64
RxrbP28704 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,3■■□□□ 1,64
RxrbP28704 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,29■■□□□ 1,64
RxrbP28704 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,29■■□□□ 1,64
RxrbP28704 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,28■■□□□ 1,64
RxrbP28704 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25,28■■□□□ 1,64
RxrbP28704 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC25,27■■□□□ 1,64
RxrbP28704 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC25,26■■□□□ 1,63
RxrbP28704 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,26■■□□□ 1,63
RxrbP28704 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25,26■■□□□ 1,63
RxrbP28704 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC25,26■■□□□ 1,63
RxrbP28704 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25,25■■□□□ 1,63
RxrbP28704 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,25■■□□□ 1,63
RxrbP28704 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25,25■■□□□ 1,63
RxrbP28704 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,25■■□□□ 1,63
RxrbP28704 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,24■■□□□ 1,63
RxrbP28704 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,24■■□□□ 1,63
RxrbP28704 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC25,23■■□□□ 1,63
RxrbP28704 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,23■■□□□ 1,63
RxrbP28704 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,23■■□□□ 1,63
RxrbP28704 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC25,22■■□□□ 1,63
RxrbP28704 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC25,2■■□□□ 1,63
RxrbP28704 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,2■■□□□ 1,63
RxrbP28704 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC25,18■■□□□ 1,62
RxrbP28704 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,18■■□□□ 1,62
RxrbP28704 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,18■■□□□ 1,62
RxrbP28704 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,18■■□□□ 1,62
RxrbP28704 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,17■■□□□ 1,62
RxrbP28704 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,17■■□□□ 1,62
RxrbP28704 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,16■■□□□ 1,62
RxrbP28704 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,14■■□□□ 1,61
RxrbP28704 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,14■■□□□ 1,61
RxrbP28704 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25,13■■□□□ 1,61
RxrbP28704 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC25,12■■□□□ 1,61
RxrbP28704 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC25,12■■□□□ 1,61
RxrbP28704 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC25,11■■□□□ 1,61
RxrbP28704 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,1■■□□□ 1,61
RxrbP28704 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,09■■□□□ 1,61
RxrbP28704 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25,09■■□□□ 1,61
RxrbP28704 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC25,08■■□□□ 1,61
RxrbP28704 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,08■■□□□ 1,61
RxrbP28704 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC25,07■■□□□ 1,6
RxrbP28704 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,07■■□□□ 1,6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23,7 ms