Protein–RNA interactions for Protein: P28654

Dcn, Decorin, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DcnP28654 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22,66■■□□□ 1,22
DcnP28654 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC22,66■■□□□ 1,22
DcnP28654 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22,65■■□□□ 1,22
DcnP28654 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC22,65■■□□□ 1,22
DcnP28654 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC22,65■■□□□ 1,22
DcnP28654 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22,65■■□□□ 1,22
DcnP28654 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22,64■■□□□ 1,21
DcnP28654 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22,61■■□□□ 1,21
DcnP28654 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,61■■□□□ 1,21
DcnP28654 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22,6■■□□□ 1,21
DcnP28654 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,6■■□□□ 1,21
DcnP28654 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,59■■□□□ 1,21
DcnP28654 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22,59■■□□□ 1,21
DcnP28654 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,59■■□□□ 1,21
DcnP28654 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC22,59■■□□□ 1,21
DcnP28654 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22,59■■□□□ 1,21
DcnP28654 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22,59■■□□□ 1,21
DcnP28654 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,58■■□□□ 1,21
DcnP28654 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22,57■■□□□ 1,2
DcnP28654 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22,57■■□□□ 1,2
DcnP28654 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22,56■■□□□ 1,2
DcnP28654 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22,54■■□□□ 1,2
DcnP28654 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC22,53■■□□□ 1,2
DcnP28654 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22,52■■□□□ 1,2
DcnP28654 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22,5■■□□□ 1,19
DcnP28654 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,5■■□□□ 1,19
DcnP28654 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22,5■■□□□ 1,19
DcnP28654 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22,5■■□□□ 1,19
DcnP28654 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,48■■□□□ 1,19
DcnP28654 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22,48■■□□□ 1,19
DcnP28654 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22,48■■□□□ 1,19
DcnP28654 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22,48■■□□□ 1,19
DcnP28654 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC22,47■■□□□ 1,19
DcnP28654 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22,47■■□□□ 1,19
DcnP28654 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22,46■■□□□ 1,19
DcnP28654 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC22,46■■□□□ 1,19
DcnP28654 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC22,46■■□□□ 1,19
DcnP28654 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22,45■■□□□ 1,18
DcnP28654 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22,44■■□□□ 1,18
DcnP28654 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22,42■■□□□ 1,18
DcnP28654 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,42■■□□□ 1,18
DcnP28654 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC22,41■■□□□ 1,18
DcnP28654 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC22,41■■□□□ 1,18
DcnP28654 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC22,41■■□□□ 1,18
DcnP28654 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22,4■■□□□ 1,18
DcnP28654 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC22,4■■□□□ 1,18
DcnP28654 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,4■■□□□ 1,18
DcnP28654 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22,4■■□□□ 1,18
DcnP28654 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,4■■□□□ 1,18
DcnP28654 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,38■■□□□ 1,17
DcnP28654 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22,38■■□□□ 1,17
DcnP28654 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22,37■■□□□ 1,17
DcnP28654 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,37■■□□□ 1,17
DcnP28654 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22,36■■□□□ 1,17
DcnP28654 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22,36■■□□□ 1,17
DcnP28654 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22,35■■□□□ 1,17
DcnP28654 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,35■■□□□ 1,17
DcnP28654 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22,35■■□□□ 1,17
DcnP28654 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22,35■■□□□ 1,17
DcnP28654 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC22,34■■□□□ 1,17
DcnP28654 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,34■■□□□ 1,17
DcnP28654 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,33■■□□□ 1,17
DcnP28654 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22,33■■□□□ 1,17
DcnP28654 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22,33■■□□□ 1,16
DcnP28654 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22,32■■□□□ 1,16
DcnP28654 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22,31■■□□□ 1,16
DcnP28654 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22,31■■□□□ 1,16
DcnP28654 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,31■■□□□ 1,16
DcnP28654 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,31■■□□□ 1,16
DcnP28654 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22,3■■□□□ 1,16
DcnP28654 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22,3■■□□□ 1,16
DcnP28654 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22,29■■□□□ 1,16
DcnP28654 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC22,29■■□□□ 1,16
DcnP28654 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC22,29■■□□□ 1,16
DcnP28654 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22,29■■□□□ 1,16
DcnP28654 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22,28■■□□□ 1,16
DcnP28654 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,28■■□□□ 1,16
DcnP28654 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22,28■■□□□ 1,16
DcnP28654 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,28■■□□□ 1,16
DcnP28654 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22,28■■□□□ 1,16
DcnP28654 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22,26■■□□□ 1,15
DcnP28654 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,26■■□□□ 1,15
DcnP28654 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,26■■□□□ 1,15
DcnP28654 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22,26■■□□□ 1,15
DcnP28654 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22,25■■□□□ 1,15
DcnP28654 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,25■■□□□ 1,15
DcnP28654 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22,25■■□□□ 1,15
DcnP28654 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,24■■□□□ 1,15
DcnP28654 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22,23■■□□□ 1,15
DcnP28654 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,22■■□□□ 1,15
DcnP28654 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,22■■□□□ 1,15
DcnP28654 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,22■■□□□ 1,15
DcnP28654 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC22,21■■□□□ 1,15
DcnP28654 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22,21■■□□□ 1,15
DcnP28654 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,2■■□□□ 1,14
DcnP28654 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22,2■■□□□ 1,14
DcnP28654 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22,2■■□□□ 1,14
DcnP28654 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,19■■□□□ 1,14
DcnP28654 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC22,19■■□□□ 1,14
DcnP28654 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,18■■□□□ 1,14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47,5 ms